Choice of metadata Статьи ППС
Page 1, Results: 1
Report on unfulfilled requests: 0
1.
Подробнее
Г 58
Гоголев, Ю. В.
Изучение генома абк-утилизирующих ризосферных бактерий rhodococcus sp. p1y и novosphingobium sp. p6w [Текст] / Ю. В. Гоголев, Т. С. Ермеккалиев, Е. С. Султанов // Вестник ЗКУ. - 2021. - №3. - С. 167-175
ББК 28
Рубрики: Биология
Кл.слова (ненормированные):
ризобактерии -- геном -- штамм -- клонирование -- экспрессия -- ВКСМ -- Novosphingobium -- Rhodococcus -- PGPR -- ACC -- NCBI
Аннотация: Данная статья посвящена механизму микробного катаболизма. С использованием селективной питательной среды, из ризосферы риса (Oryza sativa) было выделено два бактериальных штамма, отнесенных к Rhodococcus sp. P1Y и Novosphingobium sp. P6W. Штаммы депонированы в Ведомственной коллекции полезных микроорганизмов сельскохозяйственного назначения (ВКСМ). Геномный последовательность была получена с использованием подхода, объединяющего данные последовательности Oxford Nanopore Technologies MinION и Illumina MiSeq. Было проведено секвенирование тотальной ДНК двух исследованных штаммов. Полученный геном P6W состоит из 6556287 пар нуклеотидов и включает 6009 генов, кодирующих белки, и 54 некодирующих гена РНК. Результаты представлены на сайте NCBI. Геном Rhodococcus sp. P1Y состоит из 6722294 пар нуклеотидов и включает 6411 генов, кодирующих белки, и 65 генов рибосомальной, транспортной и некодирующей РНК. Полученные результаты позволили провести функциональную аннотацию основных генов, необходимых для дальнейшего транскриптомного анализа АБК-деструкторов. Уровень идентичности геномов P6W и ближайшего штамма N. barchaimii LL02 по ANI-тесту составил 90-90,9%. Результат указывает на то, что штамм P6W является новым видом рода Novosphingobium. Видов, тесно связанных со штаммом Rhodococcus P1Y, обнаружено не было. Идентичность геномов ближайших видов не превышает 77% (Rhodococcus kyotonensis).
Держатели документа:
ЗКУ
Доп.точки доступа:
Ермеккалиев, Т.С.
Султанов, Е.С.
Г 58
Гоголев, Ю. В.
Изучение генома абк-утилизирующих ризосферных бактерий rhodococcus sp. p1y и novosphingobium sp. p6w [Текст] / Ю. В. Гоголев, Т. С. Ермеккалиев, Е. С. Султанов // Вестник ЗКУ. - 2021. - №3. - С. 167-175
Рубрики: Биология
Кл.слова (ненормированные):
ризобактерии -- геном -- штамм -- клонирование -- экспрессия -- ВКСМ -- Novosphingobium -- Rhodococcus -- PGPR -- ACC -- NCBI
Аннотация: Данная статья посвящена механизму микробного катаболизма. С использованием селективной питательной среды, из ризосферы риса (Oryza sativa) было выделено два бактериальных штамма, отнесенных к Rhodococcus sp. P1Y и Novosphingobium sp. P6W. Штаммы депонированы в Ведомственной коллекции полезных микроорганизмов сельскохозяйственного назначения (ВКСМ). Геномный последовательность была получена с использованием подхода, объединяющего данные последовательности Oxford Nanopore Technologies MinION и Illumina MiSeq. Было проведено секвенирование тотальной ДНК двух исследованных штаммов. Полученный геном P6W состоит из 6556287 пар нуклеотидов и включает 6009 генов, кодирующих белки, и 54 некодирующих гена РНК. Результаты представлены на сайте NCBI. Геном Rhodococcus sp. P1Y состоит из 6722294 пар нуклеотидов и включает 6411 генов, кодирующих белки, и 65 генов рибосомальной, транспортной и некодирующей РНК. Полученные результаты позволили провести функциональную аннотацию основных генов, необходимых для дальнейшего транскриптомного анализа АБК-деструкторов. Уровень идентичности геномов P6W и ближайшего штамма N. barchaimii LL02 по ANI-тесту составил 90-90,9%. Результат указывает на то, что штамм P6W является новым видом рода Novosphingobium. Видов, тесно связанных со штаммом Rhodococcus P1Y, обнаружено не было. Идентичность геномов ближайших видов не превышает 77% (Rhodococcus kyotonensis).
Держатели документа:
ЗКУ
Доп.точки доступа:
Ермеккалиев, Т.С.
Султанов, Е.С.
Page 1, Results: 1