Choice of metadata Статьи
Page 1, Results: 1
Report on unfulfilled requests: 0
1.
Подробнее
24.5
C73
Conformational behavior of hydrazone derived from pyridoxal 5’-phosphate and isoniazid [Текст] / A. Е. Pogonin [et al.] // Известия высших учебных заведений. - Иваново, 2018. - №12. - Р. 101-107. - (Серия химия и химическая технология)
ББК 24.5
Рубрики: Физическая химия. Химическая физика
Кл.слова (ненормированные):
пиридоксаль-5-фосфат -- изониазид -- гидразон -- конформер -- активационный барьер -- молекулы -- стабильный конформер -- депротонированный гидразон -- квантовая химия -- Количественный QTAIM анализ -- ионы металла -- гидразон PLP-INH3 -- молекулярный докинг -- G-белок
Аннотация: Гидразоны, производные пиридоксаля либо пиридоксаль-5-фосфата или гетероциклических гидразидов, представляют интерес, благодаря своей потенциальной биологической активности и возможности использования в качестве сенсоров на ионы металлов. Эти свойства гидразонов могут зависеть от конформационных равновесий молекулы, поскольку наиболее стабильный конформер может отличаться от формы с наибольшим сродством к биомолекуле либо иону металла. В настоящей работе депротонированный гидразон, производный пиридоксаль-5-фосфата и изониазида (PLP-INH3-), исследован методами квантовой химии. Для этого гидразона возможны 3 различных вращения, приводящих к 8 конформерам, однако 4 из них, полученные при вращении пиридинового кольца остатка изониазида, являются вырожденными. С использованием теории функционала плотности (B3LYP/6-311++G(d,p)) были оптимизированы геометрические характеристики различных невырожденных конформеров вращения данного гидразона (различающихся взаимной ориентацией карбонильной группы остатка изониазида и атома кислорода в положении 3 остатка PLP), а также оценены активационные барьеры переходов между ними. Обсуждаются изменения в энергии и строении конформеров, а также переходных состояний. Количественный QTAIM (Quantum Theory of Atoms in Molecules) анализ был проведен с целью проверки наличия внутримолекулярных водородных связей. Формы гидразона, способные образовывать комплекс с ионами металлов, отличаются от наиболее устойчивых (по величинам полной энергии) конформеров. Была проведена предварительная оценка биологической активности гидразона PLP-INH3-, а также молекулярный докинг для гидразона и киназы G-белок сопряженного рецептора. Определена предпочтительная конформация для связывания лиганда с активным сайтом киназы.
Держатели документа:
ЗКГУ
Доп.точки доступа:
Pogonin, A.Е.
Gamov , G.A.
Zavalishin , M.N.
Sharnin , V.A.
C73
Conformational behavior of hydrazone derived from pyridoxal 5’-phosphate and isoniazid [Текст] / A. Е. Pogonin [et al.] // Известия высших учебных заведений. - Иваново, 2018. - №12. - Р. 101-107. - (Серия химия и химическая технология)
Рубрики: Физическая химия. Химическая физика
Кл.слова (ненормированные):
пиридоксаль-5-фосфат -- изониазид -- гидразон -- конформер -- активационный барьер -- молекулы -- стабильный конформер -- депротонированный гидразон -- квантовая химия -- Количественный QTAIM анализ -- ионы металла -- гидразон PLP-INH3 -- молекулярный докинг -- G-белок
Аннотация: Гидразоны, производные пиридоксаля либо пиридоксаль-5-фосфата или гетероциклических гидразидов, представляют интерес, благодаря своей потенциальной биологической активности и возможности использования в качестве сенсоров на ионы металлов. Эти свойства гидразонов могут зависеть от конформационных равновесий молекулы, поскольку наиболее стабильный конформер может отличаться от формы с наибольшим сродством к биомолекуле либо иону металла. В настоящей работе депротонированный гидразон, производный пиридоксаль-5-фосфата и изониазида (PLP-INH3-), исследован методами квантовой химии. Для этого гидразона возможны 3 различных вращения, приводящих к 8 конформерам, однако 4 из них, полученные при вращении пиридинового кольца остатка изониазида, являются вырожденными. С использованием теории функционала плотности (B3LYP/6-311++G(d,p)) были оптимизированы геометрические характеристики различных невырожденных конформеров вращения данного гидразона (различающихся взаимной ориентацией карбонильной группы остатка изониазида и атома кислорода в положении 3 остатка PLP), а также оценены активационные барьеры переходов между ними. Обсуждаются изменения в энергии и строении конформеров, а также переходных состояний. Количественный QTAIM (Quantum Theory of Atoms in Molecules) анализ был проведен с целью проверки наличия внутримолекулярных водородных связей. Формы гидразона, способные образовывать комплекс с ионами металлов, отличаются от наиболее устойчивых (по величинам полной энергии) конформеров. Была проведена предварительная оценка биологической активности гидразона PLP-INH3-, а также молекулярный докинг для гидразона и киназы G-белок сопряженного рецептора. Определена предпочтительная конформация для связывания лиганда с активным сайтом киназы.
Держатели документа:
ЗКГУ
Доп.точки доступа:
Pogonin, A.Е.
Gamov , G.A.
Zavalishin , M.N.
Sharnin , V.A.
Page 1, Results: 1