Электронный каталог

28.070
С 56

    Совместное влияние аминокислотной последовательности ДНК на структуру хроматосомы: анализ методами молекулярного моделирования [Текст] / Т. К. Горковец [и др.] // Вестник Московского университета . - Москва, 2018. - №2. - С. 99-105
ББК 28.070

Рубрики: Молекулярная биология

Кл.слова (ненормированные):
хроматосома -- нуклеосома -- хроматин -- линкерный гистон -- линкерная ДНК -- гибкость ДНК -- моделирование по гомологии
Аннотация: Хроматосома, состоящая из нуклеосомного ядра, линкерных участков ДНК и линкерного гистона (ЛГ), является важным структурным элементом хроматина
Держатели документа:
ЗКГУ
Доп.точки доступа:
Горковец, Т.К.
Армеев, Г.А.
Шайтан, К.В.
Шайтан, А.К.

28.0
Ч-50
Чертков, О. В.
    Очистка элонгационных комплексов РНК-полимеразы для изучения методом криоэлектронной микроскопии [Текст] / О. В. Чертков, О. В. Чертков [и др.] // Вестник Московского университета . - Москва, 2018. - №3. - С. 173-177. - (Серия 16, Биология)
ББК 28.0

Рубрики: Общая биология

Кл.слова (ненормированные):
РНК-полимераза -- нуклеосома -- элонгационный комплекс -- аффинная сетка -- очистка белка -- электронная микроскопия -- криоэлектронная микроскопия -- ДНК-матрица -- сборка нуклеосом
Аннотация: Разработана методика подготовки образца остановленного элонгационного комплекса РНК-полимеразы Escherichia coli с нуклеосомой для исследования с помощью криоэлектронной микроскопии. Разработана методика очистки комплекса от избытка свободной РНК-полимеразы и непродуктивных комплексов на гепариновой смоле. Для концентрирования элонгационного комплекса был применен аффинный монослой, сформированный липидами, связанными с ионами Ni. Применение подготовленных аффинных сеток с иммобилизированным монослоем липидов позволило предотвратить агрегацию частиц комплекса на поверхности сетки. Разработанная методика может применяться для получения трехмерной реконструкции элонгационного комплекса ЕС+39.
Держатели документа:
ЗКГУ
Доп.точки доступа:
Карлова, М.Г.
Герасимова, Н.С.
Соколова, О.С.

28.04
О-23

    Обратимость индуцированных ионной силой структурных перестроек в мононуклеосомах [Текст] / А. В. Феофанов [и др.] // Вестник Национальной инженерной академии Республики Казахстан. - Москва, 2018. - №3. - С. 191-196. - (Серия 16, Биология)
ББК 28.04

Рубрики: Молекулярная генетика

Кл.слова (ненормированные):
хроматин -- нуклеосома -- ионная сила -- флуоресценция -- микроскопия -- одиночная молекула -- структурные перестройки -- генетическая информация -- ДНК -- РНК
Аннотация: Методом флуоресцентной микроскопии одиночных частиц с регистрацией фёрстеровского резонансного переноса энергии исследованы структурные перестройки, происходящие под действием высокой ионной силы в нуклеосомах на основе ДНК-матрицы 603. Установлено, что в диапазоне концентраций KCl 0,7–1,3 М в нуклеосомах происходят масштабные изменения структуры, сопровождающиеся образованием по меньшей мере двух состояний, отличающихся степенью отворачивания ДНК от октамера гистонов, и затрагивающие от 13 до 35 и более пар нуклеотидов. Доля нуклеосом с измененной структурой варьирует от 60% при 0,7 М KCl до 100% при 1,3 М KCl. Сохранение ассоциации между коровыми гистонами и ДНК в новых конформационных состояниях обеспечивает обратимость структурных изменений при снижении концентрации KCl до физиологического уровня. Обратимость достигает ~100% при переходе от 0,7 М к 0,15 М KCl и снижается до ~50% при переходе от 1,3 М к 0,15 М KCl.
Держатели документа:
ЗКГУ
Доп.точки доступа:
Феофанов, А.В.
Андреева, Т.В.
Студитский , В.М.
Кирпичников, М.П.

51.1(2)
Ч-50
Чертков, О. В.
    Анализ структуры нуклеосом в полиакриламидном геле методом ферстеровского резонансного переноса энергии [Текст] / О. В. Чертков // Вестник Московского университета. - 2017. - №4. - С. 229-234
ББК 51.1(2)

Рубрики: Социальная гигиена и организация здравоохранения

Кл.слова (ненормированные):
нуклеосома -- флуоресценция -- электрофорез -- перенос энергии -- микрокопия -- эпигенетика
Аннотация: На основе эффекта Фёрстеровского резонансного переноса энергии (FRET) разработана методика анализа структуры (Су3, Су5)-меченных нуклеосом в полиакриламидном геле после электрофореза в нативных условиях. Показано, что корректное применение этой методики требует контроля за неспецифическим межмолекулярным FRET и перепоглощением флуоресценции. Проведен сравнительный анализ результатов FRET-измерений двух типов нуклеосом и их комплексов с дрожжевым белком FACT, который подтвердил сходство структурных особенностей нуклеосом, выявляемых в геле и в водном растворе. Применение FRET-анализа в комбинации с электрофорезом позволяет не только разделить и визуализировать компоненты сложной смеси, оценив их относительное содержание, но и охарактеризовать структурные отличия этих компонентов in situ.
Держатели документа:
ЗКГУ
Доп.точки доступа:
Валиева, М.Е.
Малюченко, Н.В.
Феофанов, А.В.

28.070
Х 97
Хсиех, Ф. К.
    Роль белка NHP6 транскрипции нуклеосом IN VITRO [Текст] / Ф. К. Хсиех // Вестник Московского университета. - 2017. - №4. - С. 253-257
ББК 28.070

Рубрики: Молекулярная биология

Кл.слова (ненормированные):
хроматин -- нуклеосома -- транскрипция -- FACT -- Nhp6 -- Spt16 -- Pob3
Держатели документа:
ЗКГУ
Доп.точки доступа:
Козлова, А.Л.
Герасимова, Н.С.
Котова, Е.Ю.
Формоза, Т.
Студитский , В.М.

28
М 18
Малюченко, Н. В.
    Влияние госсипола на структуру нуклеосом [Текст] / Н. В. Малюченко, Д. О. Кошкина [и др.] // Вестник Московского университета. - 2020. - №3. - С. 170-175
ББК 28

Рубрики: Биология

Кл.слова (ненормированные):
госсипол -- нуклеосома -- хроматин -- флуоресценция -- ферстеровский резонансный перенос энергии
Аннотация: В статье методом микроскопии одиночных частиц на основе Фёрстеровского резонансного переноса энергии установлено, что при концентрациях 10мкМ и выше госсипол вызывает значительные структурные изменения в конформации нуклеосомной ДНК на октамере гистонов.
Держатели документа:
ЗКУ
Доп.точки доступа:
Кошкина, Д.О.
Коровина, А.Н.
Герасимова, Н.С.
Кирпичников, М.П.
Студитский, В.М.
Феофанов, А.В.

28.072
Р 68

    Роль белка Nhp6 в разворачивании нуклеосом фактором FACT [Текст] / А. Л. Сивкина , А. В. Феофанов , М. П. Кирпичников [и др.] // Вестник Московского университета. - 2021. - №4. - С. 213-218
ББК 28.072

Рубрики: Общая биохимия

Кл.слова (ненормированные):
хроматин -- нуклеосома -- FACT -- Spt16 -- Pob3 -- Nhp6
Аннотация: Контролируемый доступ к ДНК в составе хроматина, необходимый для экспрессии генов, обеспечивается регуляторными факторами – такими, как белковый комплекс FACT. Как установлено ранее, дрожжевой FACT (yFACT) в присутствии белка Nhp6 осуществляет АТФ-независимое обратимое разворачивание нуклеосом, механизм которого требует детального изучения. В настоящей работе с целью изучения механизма разворачивания нуклеосом исследовано, достаточно ли одной молекулы Nhp6 для раскручивания нуклеосомной ДНК фактором yFACT или реорганизация структуры нуклеосомы требует совместного действия yFACT и нескольких молекул Nhp6. Исследования, проведенные методом электрофореза в нативных условиях, показали, что yFACT может связывать не менее трех молекул Nhp6. С помощью микроскопии одиночных частиц на основе Ферстеровского резонансного переноса энергии установлено, что при увеличении соотношения yFACT:Nhp6 с 1:10 до 1:1 при постоянной концентрации Nhp6 способность yFACT разворачивать нуклеосомы не повышается, а снижается. Следовательно, для разворачивания нуклеосом необходимо связывание более одной молекулы Nhp6 в комплексе нуклеосома:yFACT:Nhp6. Полученные данные уточняют существующие представления о реорганизации структуры нуклеосом фактором yFACT.
Держатели документа:
ЗКУ
Доп.точки доступа:
Сивкина , А.Л.
Феофанов , А.В.
Кирпичников , М.П.
Ахтар , М.С.
Студитский , В.М.