Электронный каталог

24.5
C73

    Conformational behavior of hydrazone derived from pyridoxal 5’-phosphate and isoniazid [Текст] / A. Е. Pogonin [et al.] // Известия высших учебных заведений. - Иваново, 2018. - №12. - Р. 101-107. - (Серия химия и химическая технология)
ББК 24.5

Рубрики: Физическая химия. Химическая физика

Кл.слова (ненормированные):
пиридоксаль-5-фосфат -- изониазид -- гидразон -- конформер -- активационный барьер -- молекулы -- стабильный конформер -- депротонированный гидразон -- квантовая химия -- Количественный QTAIM анализ -- ионы металла -- гидразон PLP-INH3 -- молекулярный докинг -- G-белок
Аннотация: Гидразоны, производные пиридоксаля либо пиридоксаль-5-фосфата или гетероциклических гидразидов, представляют интерес, благодаря своей потенциальной биологической активности и возможности использования в качестве сенсоров на ионы металлов. Эти свойства гидразонов могут зависеть от конформационных равновесий молекулы, поскольку наиболее стабильный конформер может отличаться от формы с наибольшим сродством к биомолекуле либо иону металла. В настоящей работе депротонированный гидразон, производный пиридоксаль-5-фосфата и изониазида (PLP-INH3-), исследован методами квантовой химии. Для этого гидразона возможны 3 различных вращения, приводящих к 8 конформерам, однако 4 из них, полученные при вращении пиридинового кольца остатка изониазида, являются вырожденными. С использованием теории функционала плотности (B3LYP/6-311++G(d,p)) были оптимизированы геометрические характеристики различных невырожденных конформеров вращения данного гидразона (различающихся взаимной ориентацией карбонильной группы остатка изониазида и атома кислорода в положении 3 остатка PLP), а также оценены активационные барьеры переходов между ними. Обсуждаются изменения в энергии и строении конформеров, а также переходных состояний. Количественный QTAIM (Quantum Theory of Atoms in Molecules) анализ был проведен с целью проверки наличия внутримолекулярных водородных связей. Формы гидразона, способные образовывать комплекс с ионами металлов, отличаются от наиболее устойчивых (по величинам полной энергии) конформеров. Была проведена предварительная оценка биологической активности гидразона PLP-INH3-, а также молекулярный докинг для гидразона и киназы G-белок сопряженного рецептора. Определена предпочтительная конформация для связывания лиганда с активным сайтом киназы.
Держатели документа:
ЗКГУ
Доп.точки доступа:
Pogonin, A.Е.
Gamov , G.A.
Zavalishin , M.N.
Sharnin , V.A.

24.5
К 32

    Квантово-химическое определение теплоты гидратации диэтилсульфона [Текст] / А. С. Мхитарян [и др.] // Известия высших учебных заведений. Серия: Химия и химическая технология. - 2018. - Т.61(8). - С. 17-21
ББК 24.5

Рубрики: Физическая химия. Химическая физика

Кл.слова (ненормированные):
диэтилсульфон -- квантово-химический расчет -- модель самосогласованного реактивного поля -- гидратация -- химия
Аннотация: Осуществлено квантово-химическое изучение процесса гидратации диэтилсульфона с использованием программного пакета Gaussian 09. Конформационный анализ изолированной молекулы диэтилсульфона выполнен ограниченным методом Хартри-Фока (RHF) и теорией функционала плотности (DFT/B3PW91) с применением расширенного базиса с учетом поляризационных и диффузионных функций 6-311++G(d,p). Анализ поверхности потенциальной энергии выявил существование четырех стабильных конформеров диэтилсульфона с разными степенями вырождения. Характер стационарных точек на поверхности потенциальной энергии подтвержден полной оптимизацией структуры в газовой фазе и колебательным анализом. Глобальный минимум фиксируется при значениях двух торсионных углов (CCSC), равных 180°. Исходя из распределения Больцмана проведена оценка относительной заселенности равновесных конформаций. Рассчитана средняя энергия молекулы диэтилсульфона в вакууме с учетом относительной заселенности равновесных конформаций. Модель самосогласованного реактивного поля (SCRF) и, в частности, модель растворителя на основе электронной плотности (SMD), применена для проведения расчетов с учетом растворителя. Показано, что растворитель имеет влияние на относительную заселенность равновесных конформаций. По данным квантово-химических расчетов определены термодинамические параметры конформеров диэтилсульфона, в частности энтальпии, как в газовой фазе, так и в водном растворе. Рассчитана средняя энергия молекулы диэтилсульфона в водной среде. Показано, что хотя процесс растворения кристаллического диэтилсульфона в воде имеет эндотермический характер, гидратация молекул диэтилсульфона, рассчитанная в газовой фазе, протекает с выделением теплоты. Рассчитанная теорией функционала плотности теплота растворения диэтилсульфона сопоставима с имеющимися в литературе экпериментальными данными.
Держатели документа:
ЗКГУ
Доп.точки доступа:
Мхитарян, А.С.
Папанян, З.Х.
Габриелян, Л.С.
Маркарян, Ш.А.

24
К 93
Курочкин, И. Ю.
    DFT изучение молекулярной структуры 5,10,15,20-тетракис (4'-галогенфенил)порфинов и их изомеров [Текст] / И. Ю. Курочкин, А. Е. Погонин [и др.] // Известия высших учебных заведений серия Химия и химическая технология. - 2020. - Т.63 (1). - С. 51-57
ББК 24

Рубрики: Химические науки

Кл.слова (ненормированные):
вантово-химические расчеты -- теория функционала плотности, -- порфирин -- конформа-ционный анализ
Аннотация: Настоящая статья является продолжением работ по установлению чувстви-тельности электронографического метода в отношении определения конформационного со-става макроциклических молекул, осложненных введением групп-заместителей различной природы. С помощью квантово-химических расчетов (метод DFT, функционал B3LYP) изу-чено конформационное многообразие 5,10,15,20-тетракис(4-X)фенилпорфинов (п-4C6H4X-H2P: X= F, Br). Рассмотренные конформеры отличаются положением -4C6H4Xгрупп отно-сительно макроцикла. Относительные энергии конформеров C6H4F-H2Pбыли вычислены с использованием различных базисных наборовс целью подбораварианта, наиболее оптималь-ногопо соотношению «качество расчета/вычислительная стоимость». Согласно результа-там расчетов наиболее энергетически выгодной структурой п-4C6H4X-H2Pявляется кон-формер симметрии C2v. В то же время, относительные энергии других конформеров весьма малы, поэтому их возможное присутствие в паре необходимо учитывать при обработке экс-периментальных электронографических (ЭГ) данных. Замена атомов Fна атомы Brпри пе-реходе 4C6H4F-H2P→4C6H4Br-H2Pне приводит к значительным изменениям строения пор-фиринового остова. Выполнен анализ чувствительности метода газовой электронографии к структурным изменениям, обусловленным различным положением галогенфенильных заме-стителей. Сопоставлены теоретические функции радиального распределения f(r) конформе-ров п-4C6H4X-H2P, а также мета-и орто-изомеров –м-4C6H4X-H2Pи о-4C6H4X-H2P. Резуль-таты моделирования свидетельствуют о возможности надежного экспериментального определения расстояний между химически связанными атомами, в то время какуточнение положения галогенфенильных заместителей относительно макроциклического остова мо-лекулы находится на пределе возможностей метода. На основе экспериментальных данных можно надежно различить мета-и орто-изомеры 4C6H4X-H2P, в особенности, в случаебромзамещенных фенильных групп.
Держатели документа:
ЗКГУ
Доп.точки доступа:
Погонин, А.Е.
Отлетов, А.А.
Киселев, А.Н.
Гиричев, Г.В.

24
И 21
Иванова, Ю.Б.
    Флуресцентные свойства фенил-содержащих изомеров палладиевых комплексов октаэтилпорфина в ацетонитриле [Текст] / Ю.Б. Иванова, О.А. Дмитриева [и др.] // Известия высших учебных заведений серия Химия и химическая технология. - 2020. - Т.63 (1). - С. 71-77
ББК 24

Рубрики: Химические науки

Кл.слова (ненормированные):
палладиевые комплексы порфирина -- изомеры -- флуоресценция -- конформация
Аннотация: В работе проведены флуориметрические измерения ацетонитрильных растворов палладиевых комплексов октаэтилпорфирина, 5,10 –дифенилоктаэтилпорфирина, 5,15 –дифенилоктаэтилпорфирина при 293К. В качестве стандартов (эталонов) использовался тетрафенилпорфин в толуоле. Определено, что исследуемые соединения различаются архи-тектурой периферического замещения, и, как следствие, молекулярной конформацией и сим-метрией, которые определяют скорости внутримолекулярных процессов дезактивации энергии электронного возбуждения. Установлено, что введение в мезо-положения тетра-пиррольного макроцикла молекулы октаэтилпорфирина двух фенильных фрагментов за-метно меняет спектрально-люминесцентные свойства их палладиевых комплексов. Соеди-нение с соседним расположением фенильных фрагментов 5,10–дифенилоктаэтилпорфирина характеризуется сосредоточенными стерическим взаимодействиями в области одного квад-ранта макроцикла, содержащего две фенильных группы и расположенный между ними пир-рольный фрагмент. Такое расположение фенильных фрагментов приводит к формированию асимметрично искаженного конформера седлообразного типа,о чем свидетельствует ба-тохромный сдвиг полос в электронном спектре поглощения на 495 см-1. Квантовый выход S1→S0флуоресценции слабо уменьшается до 4,6·10-3, что объясняется формированием нового конкурирующего канала безызлучательной дезактивации –внутренней S1→S0конверсии, ко-торая характерна для седлообразно искаженных конформеров порфиринов. При размещении фенильных групп в противолежащих мезо-положениях макроцикла 5,15 –дифенилок-таэтилпорфирина, фланкированных алкильными группами в Cb-положениях пиррольных ко-лец, формируется конформер с вытянутым по оси Cm-Cmмакроциклом. Это,вероятно,свя-зано с более жесткой молекулярной структурой данного конформера по сравнению с палла-дий октаэтилпорфирином и отсутствием конформационной динамики в возбужденном S1состоянии.В результате батохромный сдвиг полос в электронном спектре поглощения пал-ладий 5,15 –дифенилоктаэтилпорфирина оказывается меньше и составляет всего 100 см-1,и квантовый выход S1→S0флуоресценции практически равен квантовому выходу палладие-вого комплексаоктаэтилпорфирин –5,4·10-3, что,вероятно,связано с низкой безызлучатель-ной внутренней S1→S0 конверсией для 5,15 –дифенилоктаэтилпорфирина по сравнению с 5,10–дифенилоктаэтилпорфирина
Держатели документа:
ЗКГУ
Доп.точки доступа:
Дмитриева, О.А.
Семейкин, А.С.
Пуховская, С.Г.
Крук, Н.Н.
Мамардашвили, Н.Ж.