База данных: Статьи
Страница 1, Результатов: 6
Отмеченные записи: 0
1.
Подробнее
24.5
Н 76
Новоселецкий, В. Н.
Составление и анализ матриц аминокислотных замен для оптимального выравнивания последовательностей микробных родопсинов [Текст] / В. Н. Новоселецкий, Г. А. Армеев, К. В. Шайтан // Вестник Московского университета . - Москва, 2019. - №1. - С. 27-33. - (Серия биология)
ББК 24.5
Рубрики: Физическая химия
Кл.слова (ненормированные):
микробные родопсины -- гелиородопсин -- матрица замен -- энтропия -- выравнивание последовательностей -- поиск гомологов -- аминокислотные замены -- биоинформатика -- фотохимически активные белки -- прокариот -- эукариот -- электрохимический потенциал
Аннотация: Парное выравнивание аминокислотных последовательностей является основным инструментом биоинформатики, используемым как самостоятельно, так и в большом числе более сложных методов. Эффективность этого инструмента критически зависит от используемой оценочной функции, которая состоит из матрицы замен и штрафов за вставку. В настоящей работе выполнены построение и анализ матриц аминокислотных замен для надсемейства микробных родопсинов (RHOD), а также проведено их сопоставление с рядом матриц замен общего назначения (BLOSUM, VTML, PFASUM). Показано, что все матрицы позволяют строить выравнивания последовательностей микробных родопсинов практически одинакового качества, но лишь матрицы семейств BLOSUM и VTML, а также их линейные комбинации с матрицами семейства RHOD позволяют обнаруживать гомологию между микробными родопсинами и гелиородопсином.
Держатели документа:
ЗКГУ
Доп.точки доступа:
Армеев, Г.А.
Шайтан, К.В.
Н 76
Новоселецкий, В. Н.
Составление и анализ матриц аминокислотных замен для оптимального выравнивания последовательностей микробных родопсинов [Текст] / В. Н. Новоселецкий, Г. А. Армеев, К. В. Шайтан // Вестник Московского университета . - Москва, 2019. - №1. - С. 27-33. - (Серия биология)
Рубрики: Физическая химия
Кл.слова (ненормированные):
микробные родопсины -- гелиородопсин -- матрица замен -- энтропия -- выравнивание последовательностей -- поиск гомологов -- аминокислотные замены -- биоинформатика -- фотохимически активные белки -- прокариот -- эукариот -- электрохимический потенциал
Аннотация: Парное выравнивание аминокислотных последовательностей является основным инструментом биоинформатики, используемым как самостоятельно, так и в большом числе более сложных методов. Эффективность этого инструмента критически зависит от используемой оценочной функции, которая состоит из матрицы замен и штрафов за вставку. В настоящей работе выполнены построение и анализ матриц аминокислотных замен для надсемейства микробных родопсинов (RHOD), а также проведено их сопоставление с рядом матриц замен общего назначения (BLOSUM, VTML, PFASUM). Показано, что все матрицы позволяют строить выравнивания последовательностей микробных родопсинов практически одинакового качества, но лишь матрицы семейств BLOSUM и VTML, а также их линейные комбинации с матрицами семейства RHOD позволяют обнаруживать гомологию между микробными родопсинами и гелиородопсином.
Держатели документа:
ЗКГУ
Доп.точки доступа:
Армеев, Г.А.
Шайтан, К.В.
2.
Подробнее
51
H99
Ivashchenko, A. T.
miRNA: Achievemebts, persptctives [Текст] / A. T. Ivashchenko, R. Ye. Niyazova [и др.] // Известия Национальной академии наук Республики Казахстан. - 2015. - №4. - С. 36-46. - (Серия Биологическая и медицинская)
ББК 51
Рубрики: Медицина
Кл.слова (ненормированные):
сайты связывания
Аннотация: Среди малых RNA важную роль играют miRNA, которые осуществляют регуляцию экспрессии генов на посттранскрипционном уровне. В работе рассмотрены свойства miRNA и их взаимо¬действие с mRNA. Показана роль miRNA в регуляции экспрессии белок-кодирующих генов участвующих в различных процессах метаболизма и развитии сердечно-сосудистых, онкологических и нейродегенератив- ных заболеваний. Установлены особенности сайтов связывания miRNA в 5'UTR, CDS и 3'UTR mRNA генов- мишеней. Показано преимущество программы MirTarget перед известными программами поиска сайтов свя¬зывания miRNA с mRNA. В mRNA многих кандидатных генов различных заболеваний выявлены одиночные сайты связывания miRNA и кластеры сайтов связывания miRNA в 5'UTR, CDS и 3'UTR mRNA. В mRNA генов транскрипционных факторов обнаружены полисайты связывания miRNA которые кодируют олигопеп¬тиды в составе белков. Анализируются взаимодействие miRNA с mRNA кандидатных генов, участвующих в сердечно-сосудистых, онкологических и нейродегенеративных заболеваниях. Обсуждаются свойства уни¬кальных miRNA имеющих сайты связывания в mRNA нескольких сот генов. Рассмотрены особенности взаи¬модействия mRNA с miRNA в составе комплекса RISC. Обсуждается роль miRNA в регуляции экспрессии генов и генома посредством взаимодействия генов с участием miRNA хозяйских генов. Предложена гипо¬теза регуляции экспрессии генов и геномов с участием miRNA. Показана роль miRNA как интегрирующей системы взаиморегуляции экспрессии генов в клетке и организме.
биоинформатика.
гены
mRNA
Держатели документа:
ЗКГУ
Доп.точки доступа:
Niyazova, R. Ye.
Atambayeva, Sh. A.
Pyrkova, A.Yu.
Aisina, D. E.
Yurikova, O. Yu.
Kondybayeva, А.
Akimniyazova1, А.
Bayzhigitova, D.
Bolshoy, A. A.
H99
Ivashchenko, A. T.
miRNA: Achievemebts, persptctives [Текст] / A. T. Ivashchenko, R. Ye. Niyazova [и др.] // Известия Национальной академии наук Республики Казахстан. - 2015. - №4. - С. 36-46. - (Серия Биологическая и медицинская)
Рубрики: Медицина
Кл.слова (ненормированные):
сайты связывания
Аннотация: Среди малых RNA важную роль играют miRNA, которые осуществляют регуляцию экспрессии генов на посттранскрипционном уровне. В работе рассмотрены свойства miRNA и их взаимо¬действие с mRNA. Показана роль miRNA в регуляции экспрессии белок-кодирующих генов участвующих в различных процессах метаболизма и развитии сердечно-сосудистых, онкологических и нейродегенератив- ных заболеваний. Установлены особенности сайтов связывания miRNA в 5'UTR, CDS и 3'UTR mRNA генов- мишеней. Показано преимущество программы MirTarget перед известными программами поиска сайтов свя¬зывания miRNA с mRNA. В mRNA многих кандидатных генов различных заболеваний выявлены одиночные сайты связывания miRNA и кластеры сайтов связывания miRNA в 5'UTR, CDS и 3'UTR mRNA. В mRNA генов транскрипционных факторов обнаружены полисайты связывания miRNA которые кодируют олигопеп¬тиды в составе белков. Анализируются взаимодействие miRNA с mRNA кандидатных генов, участвующих в сердечно-сосудистых, онкологических и нейродегенеративных заболеваниях. Обсуждаются свойства уни¬кальных miRNA имеющих сайты связывания в mRNA нескольких сот генов. Рассмотрены особенности взаи¬модействия mRNA с miRNA в составе комплекса RISC. Обсуждается роль miRNA в регуляции экспрессии генов и генома посредством взаимодействия генов с участием miRNA хозяйских генов. Предложена гипо¬теза регуляции экспрессии генов и геномов с участием miRNA. Показана роль miRNA как интегрирующей системы взаиморегуляции экспрессии генов в клетке и организме.
биоинформатика.
гены
mRNA
Держатели документа:
ЗКГУ
Доп.точки доступа:
Niyazova, R. Ye.
Atambayeva, Sh. A.
Pyrkova, A.Yu.
Aisina, D. E.
Yurikova, O. Yu.
Kondybayeva, А.
Akimniyazova1, А.
Bayzhigitova, D.
Bolshoy, A. A.
3.
Подробнее
Танирбергенова, М.
Синергетика и биоинформатика / М. Танирбергенова // История Казахстана: преподавание в школах и ВУЗах. - 2004. - _11.- С.3-9.
Рубрики: --РК
Кл.слова (ненормированные):
Использование компьютерной технологии -- История -- Методика преподавания
Танирбергенова, М.
Синергетика и биоинформатика / М. Танирбергенова // История Казахстана: преподавание в школах и ВУЗах. - 2004. - _11.- С.3-9.
Рубрики: --РК
Кл.слова (ненормированные):
Использование компьютерной технологии -- История -- Методика преподавания
4.
Подробнее
СвлтанбекЭызы, С.
Биоинформатика ж_не Синергетика технологиясын тарих сабаЭтарына Эолдану жолдары / С. СвлтанбекЭызы // НазаЭстан мвХалжмж. - 2005. - #10.-б.53-58
Рубрики: Педагогика--НР
Кл.слова (ненормированные):
на каз.язык -- Педагогика -- гджстеме
СвлтанбекЭызы, С.
Биоинформатика ж_не Синергетика технологиясын тарих сабаЭтарына Эолдану жолдары / С. СвлтанбекЭызы // НазаЭстан мвХалжмж. - 2005. - #10.-б.53-58
Рубрики: Педагогика--НР
Кл.слова (ненормированные):
на каз.язык -- Педагогика -- гджстеме
5.
Подробнее
28.5
К 98
Кырбасова, Э. А.
Өсімдіктерді зерттеудегі биоинформатикалық әдістер. [Текст] / Э. А. Кырбасова // Биология және салауаттылық негізі . - 2023. - №6. - Б. 17-24
ББК 28.5
Рубрики: Ботаника
Кл.слова (ненормированные):
өсімдіктер биоинформатикасы -- нуклеотидттер бірізділіктері -- гендер деректер базасы -- BLAST бағдарламасы -- филогенетикалық ағаш
Аннотация: Биоинформатика өсімдіктердің әртүрлі генетикалық элементтері туралы және олардың бір-бірімен қалай байланысатындығы туралы маңызды ақпаратты ашуға көмектеседі.
Держатели документа:
БҚУ
К 98
Кырбасова, Э. А.
Өсімдіктерді зерттеудегі биоинформатикалық әдістер. [Текст] / Э. А. Кырбасова // Биология және салауаттылық негізі . - 2023. - №6. - Б. 17-24
Рубрики: Ботаника
Кл.слова (ненормированные):
өсімдіктер биоинформатикасы -- нуклеотидттер бірізділіктері -- гендер деректер базасы -- BLAST бағдарламасы -- филогенетикалық ағаш
Аннотация: Биоинформатика өсімдіктердің әртүрлі генетикалық элементтері туралы және олардың бір-бірімен қалай байланысатындығы туралы маңызды ақпаратты ашуға көмектеседі.
Держатели документа:
БҚУ
6.
Подробнее
28.5
К 98
Кырбасова, Э. А.
Өсімдіктерді зерттеудегі биоинформатикалық әдістер. [Текст] / Э. А. Кырбасова // Биология және салауаттылық негізі . - 2024. - №1. - Б. 7-11
ББК 28.5
Рубрики: Ботаника
Кл.слова (ненормированные):
өсімдіктер биоинформатикасы -- нуклеотидттер бірізділіктері -- гендер деректер базасы -- BLAST бағдарламасы -- филогенетикалық ағаш
Аннотация: Биоинформатика өсімдіктердің әртүрлі генетикалық элементтері туралы және олардың бір-бірімен қалай байланысатындығы туралы маңызды ақпаратты ашуға көмектеседі.
Держатели документа:
БҚУ
К 98
Кырбасова, Э. А.
Өсімдіктерді зерттеудегі биоинформатикалық әдістер. [Текст] / Э. А. Кырбасова // Биология және салауаттылық негізі . - 2024. - №1. - Б. 7-11
Рубрики: Ботаника
Кл.слова (ненормированные):
өсімдіктер биоинформатикасы -- нуклеотидттер бірізділіктері -- гендер деректер базасы -- BLAST бағдарламасы -- филогенетикалық ағаш
Аннотация: Биоинформатика өсімдіктердің әртүрлі генетикалық элементтері туралы және олардың бір-бірімен қалай байланысатындығы туралы маңызды ақпаратты ашуға көмектеседі.
Держатели документа:
БҚУ
Страница 1, Результатов: 6