База данных: Статьи
Страница 2, Результатов: 35
Отмеченные записи: 0
11.
Подробнее
28
В 92
DNA extraction from leaves of woody plants without liquid nitrogen [Текст] = Выделение ДНК из листьев древесных растений без жидкого азота / E.A. Shadenova [et al.] // Известия НАН РК. Серия биологическая и медицинская. - 2019. - №1. - С. 76-83
ББК 28
Рубрики: Биологические науки
Кл.слова (ненормированные):
ДНК -- листья -- выделение -- спектрофотометрия -- электрофорез -- древесные растения -- жидкий азот -- биология
Аннотация: В статье описывается метод быстрого и удобного выделения геномной ДНК из листьев древесных растений. В научной статье проводится проверка стандартного метода выделения геномной ДНК из 45 видов растений. Отобранные растения являются редкими и эндемичными представителями флоры Западно-Казахстанского региона и коллекционными экзотическими особями Мангышлакского экспериментального ботанического сада. Работа предполагает сравнение с модифицированным для данных видов протоколом выделения ДНК из тканей растений. В работе используются три метода анализа ДНК: визуальный (наличие или отсутствие белого осадка, загрязнение), электрофорез и спектрофотометрия. Основываясь на результатах электрофореграмм и спектрофотометрии, было принято решение для модификации протокола выделения. Модифицированный метод выделения ДНК основан на отсутствии применения жидкого азота. Весь процесс занимает не более 3 часов. В связи с высоким содержанием танинов в изучаемых видах, увеличение времени инкубации и центрифугирования благоприятно влияют на результат выделения ДНК. Данный метод позволяет получить препараты высокого качества с концентрацией ДНК 140.32 мкг. Полученный продукт ДНК можно использовать в исследованиях молекулярной генетической идентификации и сертификации растений.
Держатели документа:
ЗКГУ
Доп.точки доступа:
Shadenova, E.A.
Mamirova, A.A.
Dzhangalina, E.D.
Kaigermazova, M.A.
Sembekov, M.
Kamidinkyzy, U.
Turganova , R.
В 92
DNA extraction from leaves of woody plants without liquid nitrogen [Текст] = Выделение ДНК из листьев древесных растений без жидкого азота / E.A. Shadenova [et al.] // Известия НАН РК. Серия биологическая и медицинская. - 2019. - №1. - С. 76-83
Рубрики: Биологические науки
Кл.слова (ненормированные):
ДНК -- листья -- выделение -- спектрофотометрия -- электрофорез -- древесные растения -- жидкий азот -- биология
Аннотация: В статье описывается метод быстрого и удобного выделения геномной ДНК из листьев древесных растений. В научной статье проводится проверка стандартного метода выделения геномной ДНК из 45 видов растений. Отобранные растения являются редкими и эндемичными представителями флоры Западно-Казахстанского региона и коллекционными экзотическими особями Мангышлакского экспериментального ботанического сада. Работа предполагает сравнение с модифицированным для данных видов протоколом выделения ДНК из тканей растений. В работе используются три метода анализа ДНК: визуальный (наличие или отсутствие белого осадка, загрязнение), электрофорез и спектрофотометрия. Основываясь на результатах электрофореграмм и спектрофотометрии, было принято решение для модификации протокола выделения. Модифицированный метод выделения ДНК основан на отсутствии применения жидкого азота. Весь процесс занимает не более 3 часов. В связи с высоким содержанием танинов в изучаемых видах, увеличение времени инкубации и центрифугирования благоприятно влияют на результат выделения ДНК. Данный метод позволяет получить препараты высокого качества с концентрацией ДНК 140.32 мкг. Полученный продукт ДНК можно использовать в исследованиях молекулярной генетической идентификации и сертификации растений.
Держатели документа:
ЗКГУ
Доп.точки доступа:
Shadenova, E.A.
Mamirova, A.A.
Dzhangalina, E.D.
Kaigermazova, M.A.
Sembekov, M.
Kamidinkyzy, U.
Turganova , R.
12.
Подробнее
28
Ж 88
Zhumatov, K.Kh.
Influenza A/H9 viruses – important infectious pathogens of wild birds, mammals and human [Текст] = Вирусы гриппа А/Н9 – актуальные инфекционные агенты диких птиц, млекопитающих животных и человека / K.Kh. Zhumatov, A.I. Kydyrmanov, M.Kh. Sayatov // Известия НАН РК. Серия биологическая и медицинская. - 2019. - №2. - С. 49-55
ББК 28
Рубрики: Биологические науки
Кл.слова (ненормированные):
вирус гриппа -- подтип А/Н9 -- птица -- геном -- изменчивость -- филогенез -- гемагглютинин -- антигенный дрейф -- биология
Аннотация: Грипп занимает одно из первых мест среди инфекционных болезней по количеству биологических видов, вовлекаемых в инфекционный процесс, характеризуется глобальным распространением и большой экономической и социальной значимостью. Повсеместная и неконтролируемаяциркуляция вирусов гриппа А объясняется, прежде всего, их уникальной вариабельностью, в основе которой лежат как точечные мутации, характерные для РНК-содержащих вирусов, так и рекомбинации и реассортации генов. В обзорной статье описываются структурные особенности, источники выделения и современная классификация возбудителей гриппа. Обобщены последние данные литературы по различным вопросам строения, экологии, патогенности и эволюционной изменчивости вирусов гриппа А/H9 различного видового происхождения. Приводятся сведения об эволюционной изменчивости вирусов этой группы циркулирующих в дикой орнитофауне, популяциях млекопитающих животных и среди населения. Делается вывод о важности вирусов гриппа А (Н9N2) как донора в процессах реассортации и обмена генетической информацией между возбудителями гриппа А различных подтипов и возникновения новых, эпидемически актуальных вариантов. Подчеркивается необходимость контроля циркуляции вирусов гриппа А (Н9N2) с целью предотвращения контактов инфицированного поголовья с людьми и возможного появления эпидемических штаммов.
Держатели документа:
ЗКГУ
Доп.точки доступа:
Kydyrmanov, A.I.
Sayatov , M.Kh.
Ж 88
Zhumatov, K.Kh.
Influenza A/H9 viruses – important infectious pathogens of wild birds, mammals and human [Текст] = Вирусы гриппа А/Н9 – актуальные инфекционные агенты диких птиц, млекопитающих животных и человека / K.Kh. Zhumatov, A.I. Kydyrmanov, M.Kh. Sayatov // Известия НАН РК. Серия биологическая и медицинская. - 2019. - №2. - С. 49-55
Рубрики: Биологические науки
Кл.слова (ненормированные):
вирус гриппа -- подтип А/Н9 -- птица -- геном -- изменчивость -- филогенез -- гемагглютинин -- антигенный дрейф -- биология
Аннотация: Грипп занимает одно из первых мест среди инфекционных болезней по количеству биологических видов, вовлекаемых в инфекционный процесс, характеризуется глобальным распространением и большой экономической и социальной значимостью. Повсеместная и неконтролируемаяциркуляция вирусов гриппа А объясняется, прежде всего, их уникальной вариабельностью, в основе которой лежат как точечные мутации, характерные для РНК-содержащих вирусов, так и рекомбинации и реассортации генов. В обзорной статье описываются структурные особенности, источники выделения и современная классификация возбудителей гриппа. Обобщены последние данные литературы по различным вопросам строения, экологии, патогенности и эволюционной изменчивости вирусов гриппа А/H9 различного видового происхождения. Приводятся сведения об эволюционной изменчивости вирусов этой группы циркулирующих в дикой орнитофауне, популяциях млекопитающих животных и среди населения. Делается вывод о важности вирусов гриппа А (Н9N2) как донора в процессах реассортации и обмена генетической информацией между возбудителями гриппа А различных подтипов и возникновения новых, эпидемически актуальных вариантов. Подчеркивается необходимость контроля циркуляции вирусов гриппа А (Н9N2) с целью предотвращения контактов инфицированного поголовья с людьми и возможного появления эпидемических штаммов.
Держатели документа:
ЗКГУ
Доп.точки доступа:
Kydyrmanov, A.I.
Sayatov , M.Kh.
13.
Подробнее
51
H99
Ivashchenko, A. T.
miRNA: Achievemebts, persptctives [Текст] / A. T. Ivashchenko, R. Ye. Niyazova [и др.] // Известия Национальной академии наук Республики Казахстан. - 2015. - №4. - С. 36-46. - (Серия Биологическая и медицинская)
ББК 51
Рубрики: Медицина
Кл.слова (ненормированные):
сайты связывания
Аннотация: Среди малых RNA важную роль играют miRNA, которые осуществляют регуляцию экспрессии генов на посттранскрипционном уровне. В работе рассмотрены свойства miRNA и их взаимо¬действие с mRNA. Показана роль miRNA в регуляции экспрессии белок-кодирующих генов участвующих в различных процессах метаболизма и развитии сердечно-сосудистых, онкологических и нейродегенератив- ных заболеваний. Установлены особенности сайтов связывания miRNA в 5'UTR, CDS и 3'UTR mRNA генов- мишеней. Показано преимущество программы MirTarget перед известными программами поиска сайтов свя¬зывания miRNA с mRNA. В mRNA многих кандидатных генов различных заболеваний выявлены одиночные сайты связывания miRNA и кластеры сайтов связывания miRNA в 5'UTR, CDS и 3'UTR mRNA. В mRNA генов транскрипционных факторов обнаружены полисайты связывания miRNA которые кодируют олигопеп¬тиды в составе белков. Анализируются взаимодействие miRNA с mRNA кандидатных генов, участвующих в сердечно-сосудистых, онкологических и нейродегенеративных заболеваниях. Обсуждаются свойства уни¬кальных miRNA имеющих сайты связывания в mRNA нескольких сот генов. Рассмотрены особенности взаи¬модействия mRNA с miRNA в составе комплекса RISC. Обсуждается роль miRNA в регуляции экспрессии генов и генома посредством взаимодействия генов с участием miRNA хозяйских генов. Предложена гипо¬теза регуляции экспрессии генов и геномов с участием miRNA. Показана роль miRNA как интегрирующей системы взаиморегуляции экспрессии генов в клетке и организме.
биоинформатика.
гены
mRNA
Держатели документа:
ЗКГУ
Доп.точки доступа:
Niyazova, R. Ye.
Atambayeva, Sh. A.
Pyrkova, A.Yu.
Aisina, D. E.
Yurikova, O. Yu.
Kondybayeva, А.
Akimniyazova1, А.
Bayzhigitova, D.
Bolshoy, A. A.
H99
Ivashchenko, A. T.
miRNA: Achievemebts, persptctives [Текст] / A. T. Ivashchenko, R. Ye. Niyazova [и др.] // Известия Национальной академии наук Республики Казахстан. - 2015. - №4. - С. 36-46. - (Серия Биологическая и медицинская)
Рубрики: Медицина
Кл.слова (ненормированные):
сайты связывания
Аннотация: Среди малых RNA важную роль играют miRNA, которые осуществляют регуляцию экспрессии генов на посттранскрипционном уровне. В работе рассмотрены свойства miRNA и их взаимо¬действие с mRNA. Показана роль miRNA в регуляции экспрессии белок-кодирующих генов участвующих в различных процессах метаболизма и развитии сердечно-сосудистых, онкологических и нейродегенератив- ных заболеваний. Установлены особенности сайтов связывания miRNA в 5'UTR, CDS и 3'UTR mRNA генов- мишеней. Показано преимущество программы MirTarget перед известными программами поиска сайтов свя¬зывания miRNA с mRNA. В mRNA многих кандидатных генов различных заболеваний выявлены одиночные сайты связывания miRNA и кластеры сайтов связывания miRNA в 5'UTR, CDS и 3'UTR mRNA. В mRNA генов транскрипционных факторов обнаружены полисайты связывания miRNA которые кодируют олигопеп¬тиды в составе белков. Анализируются взаимодействие miRNA с mRNA кандидатных генов, участвующих в сердечно-сосудистых, онкологических и нейродегенеративных заболеваниях. Обсуждаются свойства уни¬кальных miRNA имеющих сайты связывания в mRNA нескольких сот генов. Рассмотрены особенности взаи¬модействия mRNA с miRNA в составе комплекса RISC. Обсуждается роль miRNA в регуляции экспрессии генов и генома посредством взаимодействия генов с участием miRNA хозяйских генов. Предложена гипо¬теза регуляции экспрессии генов и геномов с участием miRNA. Показана роль miRNA как интегрирующей системы взаиморегуляции экспрессии генов в клетке и организме.
биоинформатика.
гены
mRNA
Держатели документа:
ЗКГУ
Доп.точки доступа:
Niyazova, R. Ye.
Atambayeva, Sh. A.
Pyrkova, A.Yu.
Aisina, D. E.
Yurikova, O. Yu.
Kondybayeva, А.
Akimniyazova1, А.
Bayzhigitova, D.
Bolshoy, A. A.
14.
Подробнее
28
B57
Bigaliev, A. B.
Molecular invesyigation of oil pollution effect on acuabiota of Kazakhstany zone of caspean sea [Текст] / A. B. Bigaliev, B. O. Bekmanov [et al.] // Известия национальной академии наук Республики Казахстан. - 2018. - №6. - С. 37-43. - (Серия Биологическая и медицинская)
ББК 28
Рубрики: Биология
Кл.слова (ненормированные):
RAPD-PCR -- ДНК -- электрофорез -- фермент -- рестриктазы -- праймеры -- полимеразная -- цепная реакция -- полиморфизм
Аннотация: Изучение влияния загрязняющих веществ на водную экосистему с целью биологической индикации территорий, подверженных антропогенному загрязнению крайне актуально для Каспийского моря. В статье представлен рестрикционный анализ ДНК рыб (Neogobiusgorlap) и полихет (Nereisdiver- sicolor) из трех ареалов прибрежной зоны Каспийского моря. В настоящее время для оценки стабильности генома широко используется метод анализа ДНК, полимеразной цепной реакции (ПЦР), разработанный в 1985 году [1]. Чувствительность ПЦР позволяет успешно анализировать даже деградированную ДНК из му¬зейных и археологических образцов. В данной работе мы использовали метод анализа RAPD-PCR. В общей отобранной выборке из 3-х биотопов оценивали от 4 до 11 фрагментов. Визуальный анализ фрагментов ДНК, полученных для образцов, имел очень высокую степень различий (различие). Все выбранные прай¬меры показали различную картину межвидовой дифференциации. Это абсолютно достоверные маркеры (gibridspecies DNA fragments) для идентификации фенотипических гибридов, изученных рыб. Для иссле¬дуемых образцов были наиболее важными праймеры ОРА-09 и ОРА-Ю. Во время анализа полимеразной цепной реакции были обнаружены спектры с полиморфной и мономорфной ДНК рыб, пойманных в местах с различным уровнем загрязнения. Определены специфические свойства ДНК-спектров исследуемых рыб и полихет. Обнаружен уникальный ДНК-фрагмента у полихет из загрязненной среды обитания, который может быть использован в качестве ДНК маркера.
Держатели документа:
ЗКГУ
Доп.точки доступа:
Bekmanov, B. O.
Jiyenbekov, A. K.
Shimshikov, В. E.
Kozhakhmetova, A. N.
B57
Bigaliev, A. B.
Molecular invesyigation of oil pollution effect on acuabiota of Kazakhstany zone of caspean sea [Текст] / A. B. Bigaliev, B. O. Bekmanov [et al.] // Известия национальной академии наук Республики Казахстан. - 2018. - №6. - С. 37-43. - (Серия Биологическая и медицинская)
Рубрики: Биология
Кл.слова (ненормированные):
RAPD-PCR -- ДНК -- электрофорез -- фермент -- рестриктазы -- праймеры -- полимеразная -- цепная реакция -- полиморфизм
Аннотация: Изучение влияния загрязняющих веществ на водную экосистему с целью биологической индикации территорий, подверженных антропогенному загрязнению крайне актуально для Каспийского моря. В статье представлен рестрикционный анализ ДНК рыб (Neogobiusgorlap) и полихет (Nereisdiver- sicolor) из трех ареалов прибрежной зоны Каспийского моря. В настоящее время для оценки стабильности генома широко используется метод анализа ДНК, полимеразной цепной реакции (ПЦР), разработанный в 1985 году [1]. Чувствительность ПЦР позволяет успешно анализировать даже деградированную ДНК из му¬зейных и археологических образцов. В данной работе мы использовали метод анализа RAPD-PCR. В общей отобранной выборке из 3-х биотопов оценивали от 4 до 11 фрагментов. Визуальный анализ фрагментов ДНК, полученных для образцов, имел очень высокую степень различий (различие). Все выбранные прай¬меры показали различную картину межвидовой дифференциации. Это абсолютно достоверные маркеры (gibridspecies DNA fragments) для идентификации фенотипических гибридов, изученных рыб. Для иссле¬дуемых образцов были наиболее важными праймеры ОРА-09 и ОРА-Ю. Во время анализа полимеразной цепной реакции были обнаружены спектры с полиморфной и мономорфной ДНК рыб, пойманных в местах с различным уровнем загрязнения. Определены специфические свойства ДНК-спектров исследуемых рыб и полихет. Обнаружен уникальный ДНК-фрагмента у полихет из загрязненной среды обитания, который может быть использован в качестве ДНК маркера.
Держатели документа:
ЗКГУ
Доп.точки доступа:
Bekmanov, B. O.
Jiyenbekov, A. K.
Shimshikov, В. E.
Kozhakhmetova, A. N.
15.
Подробнее
28.693.35
A67
Application of massive parallel sequencing for the investigation of wild birds viruses [Текст] / K. O. Karamendin [et al.] // Вестник национальной академии наук Республики Казахстан=The bulletin the national academy of sciences of the Republic Of Kazakhstan. - Almaty, 2018. - №4. - Р. 13-17
ББК 28.693.35
Рубрики: Птицы. Орнитология
Кл.слова (ненормированные):
вирус -- массовое параллельное секвенирование -- дикие птицы -- полный геном вируса -- РНК -- ДНК -- биоинформационный анализ -- вирусный патоген -- инфекционные заболевания -- парамиксовирус -- перелетные птицы
Аннотация: Идентификация вирусных патогенов имеет огромное значение для диагностики инфекционных заболеваний человека и животных. Почти все вспышки опасных инфекций последних двух десятилетий были вызваны новыми вирусами, большинство из которых происходили из природного резервуара. Экспериментальные исследования на примере парамиксовируса (ПМВ) серотипа 1 показали, что дикие птицы способны распространять и заносить слабо- или непатогенные варианты в популяцию домашних птиц, которые через несколько пассажей в организме восприимчивых птиц зачастую приобретают высокопатогенные свойства. С использованием новой технологии массового параллельного секвенирования получены сведения о генетической структуре вирусов диких птиц, принадлежащим семейству парамиксовирусов. Показана высокая эффективность метода, который позволяет одновременно секвенировать полные геномы вирусов без предварительного знания об их принадлежности к какому-либо семейству. Полученные данные позволят расширить наши знания о ходе естественной эволюции вирусов перелетных птиц.
Держатели документа:
ЗКГУ
Доп.точки доступа:
Karamendin, K. O.
Kydyrmanov, A. I.
Kasymbekov, E. T.
Daulbayeva, K. D.
Sayatov, M. H.
Fereidouni, Sasan
A67
Application of massive parallel sequencing for the investigation of wild birds viruses [Текст] / K. O. Karamendin [et al.] // Вестник национальной академии наук Республики Казахстан=The bulletin the national academy of sciences of the Republic Of Kazakhstan. - Almaty, 2018. - №4. - Р. 13-17
Рубрики: Птицы. Орнитология
Кл.слова (ненормированные):
вирус -- массовое параллельное секвенирование -- дикие птицы -- полный геном вируса -- РНК -- ДНК -- биоинформационный анализ -- вирусный патоген -- инфекционные заболевания -- парамиксовирус -- перелетные птицы
Аннотация: Идентификация вирусных патогенов имеет огромное значение для диагностики инфекционных заболеваний человека и животных. Почти все вспышки опасных инфекций последних двух десятилетий были вызваны новыми вирусами, большинство из которых происходили из природного резервуара. Экспериментальные исследования на примере парамиксовируса (ПМВ) серотипа 1 показали, что дикие птицы способны распространять и заносить слабо- или непатогенные варианты в популяцию домашних птиц, которые через несколько пассажей в организме восприимчивых птиц зачастую приобретают высокопатогенные свойства. С использованием новой технологии массового параллельного секвенирования получены сведения о генетической структуре вирусов диких птиц, принадлежащим семейству парамиксовирусов. Показана высокая эффективность метода, который позволяет одновременно секвенировать полные геномы вирусов без предварительного знания об их принадлежности к какому-либо семейству. Полученные данные позволят расширить наши знания о ходе естественной эволюции вирусов перелетных птиц.
Держатели документа:
ЗКГУ
Доп.точки доступа:
Karamendin, K. O.
Kydyrmanov, A. I.
Kasymbekov, E. T.
Daulbayeva, K. D.
Sayatov, M. H.
Fereidouni, Sasan
16.
Подробнее
28
В 58
Влияние TOR комплекса 1 на активность и экспрессию генов альдегидоксидазы у Arabidopsis Thaliana [Текст] / А. П. Кравченко [и др.] // Известия Национальной академии наук Республики Казахстан . - Алматы, 2017. - №5. - С. 57-65. - (Серия биологическая и медицинская )
ББК 28
Рубрики: Биология
Кл.слова (ненормированные):
TOR комплекс 1 -- Arabidopsis thaliana -- LST8 -- альдегидоксидаза -- AZD-8055 ингибитор -- гены -- белок -- биохимические процессы -- Геном -- эмбриональная летальность -- гормон ауксин -- гетеродимер -- Семена -- Обработка растений -- Экстракция белка -- РНК
Аннотация: TOR (Target of Rapamycin) сигнальный путь присутствует у большинства видов эукариот и выполняет общую главную функцию для всех организмов: отвечает за координацию роста, развития и выживаемости в зависимости от наличия питательных веществ, энергии и наличия различных экологических сигналов. В настоящей работе с использованием АТФ-конкурентного ингибитора AZD-8055, воздействующего на активность TOR комплекса 1, а также при использовании мутантной линии Arabidopsis thaliana lst8-1 было изучено влияние TOR комплекса 1 на активность и экспрессию генов альдегидоксидазы. При частичном ингибировании активности TOR комплекса 1 воздействием АТФ-конкурентного ингибитора и у мутантной линии lst8-1 было установлено повышение активности фермента и уровня экспрессии AO1 и AO2 генов, кодирующих альдегидоксидазу. Ввиду того, что LST8 белок является главным партнером TOR комплекса 1, а AZD-8055 ингибитор влияет на его активность, было предположено, что TOR комплекс 1 в определенных условиях может выступать в качестве фактора негативной регуляции активности альдегидоксидазы.
Держатели документа:
ЗКГУ
Доп.точки доступа:
Кравченко, А. П.
Токсобаева, Г. А.
Каусбекова, А.
Берсимбаев, Р. И.
В 58
Влияние TOR комплекса 1 на активность и экспрессию генов альдегидоксидазы у Arabidopsis Thaliana [Текст] / А. П. Кравченко [и др.] // Известия Национальной академии наук Республики Казахстан . - Алматы, 2017. - №5. - С. 57-65. - (Серия биологическая и медицинская )
Рубрики: Биология
Кл.слова (ненормированные):
TOR комплекс 1 -- Arabidopsis thaliana -- LST8 -- альдегидоксидаза -- AZD-8055 ингибитор -- гены -- белок -- биохимические процессы -- Геном -- эмбриональная летальность -- гормон ауксин -- гетеродимер -- Семена -- Обработка растений -- Экстракция белка -- РНК
Аннотация: TOR (Target of Rapamycin) сигнальный путь присутствует у большинства видов эукариот и выполняет общую главную функцию для всех организмов: отвечает за координацию роста, развития и выживаемости в зависимости от наличия питательных веществ, энергии и наличия различных экологических сигналов. В настоящей работе с использованием АТФ-конкурентного ингибитора AZD-8055, воздействующего на активность TOR комплекса 1, а также при использовании мутантной линии Arabidopsis thaliana lst8-1 было изучено влияние TOR комплекса 1 на активность и экспрессию генов альдегидоксидазы. При частичном ингибировании активности TOR комплекса 1 воздействием АТФ-конкурентного ингибитора и у мутантной линии lst8-1 было установлено повышение активности фермента и уровня экспрессии AO1 и AO2 генов, кодирующих альдегидоксидазу. Ввиду того, что LST8 белок является главным партнером TOR комплекса 1, а AZD-8055 ингибитор влияет на его активность, было предположено, что TOR комплекс 1 в определенных условиях может выступать в качестве фактора негативной регуляции активности альдегидоксидазы.
Держатели документа:
ЗКГУ
Доп.точки доступа:
Кравченко, А. П.
Токсобаева, Г. А.
Каусбекова, А.
Берсимбаев, Р. И.
17.
Подробнее
28.693.35
М 77
Мониторинг парамиксовирусов птиц в орнитофауне Казахстана (2002–2015 гг.) [Текст] / М. Х. Саятов [и др.] // Известия Национальной академии наук Республики Казахстан . - Алматы, 2017. - №5. - С. 88-95. - (Серия биологическая и медицинская )
ББК 28.693.35
Рубрики: Птицы. Орнитология
Кл.слова (ненормированные):
парамиксовирус -- птица -- отряд -- семейство -- вид -- подтип -- геном -- секвенирования -- орнитофауна -- Гусеобразные -- Курообразные -- Журавлеобразные -- Ржанкообразные -- Воробьинообразные -- Вирусы -- дикие птицы -- Поганкообразные -- Веслоногие -- Голенастые -- Фламингообразные -- Соколообразные -- Куриные -- Рябкообразные -- Голубеобразные -- Кукушкообразные -- Козедоеобразные -- Ракшеобразные -- Удодообразные -- Воробьинообразные
Аннотация: В статье обобщаются основные результаты мониторинга циркуляции парамиксовирусов в орнитофауне Казахстана в 2002-2015 гг. Дается характеристика биологических образцов, собранных в 2002- 2015 гг. от птиц различных экологических комплексов на территории РК, за весь период наблюдения выделены 69 изолятов вирусов парамиксовирусов птиц следующих пяти отрядов из 17 изученных: Гусеобразные, Курообразные, Журавлеобразные, Ржанкообразные, Воробьинообразные. Парамиксовирусы изолировались от 20 видов диких птиц относящихся к шести семействам. Казахстанские изоляты принадлежали к следующим серотипам: ПМВ-1, ПМВ-4, ПМВ-6, ПМВ-8, ПМВ-13. Такое разнообразие серотипов свидетельствуют о том, что дикие птицы в Казахстане могут быть потенциальным источником возникновения эпизоотически актуальных вариантов парамиксовирусов птиц
Держатели документа:
ЗКГУ
Доп.точки доступа:
Саятов, М. Х.
Кыдырманов, А. И.
Жуматов, К. Х.
Карамендин, К. О.
Асанова, С. Е.
Даулбаева, К. Д.
Касымбеков, Е. Т.
Хан, Е. Я.
Сулейменова, С. А.
М 77
Мониторинг парамиксовирусов птиц в орнитофауне Казахстана (2002–2015 гг.) [Текст] / М. Х. Саятов [и др.] // Известия Национальной академии наук Республики Казахстан . - Алматы, 2017. - №5. - С. 88-95. - (Серия биологическая и медицинская )
Рубрики: Птицы. Орнитология
Кл.слова (ненормированные):
парамиксовирус -- птица -- отряд -- семейство -- вид -- подтип -- геном -- секвенирования -- орнитофауна -- Гусеобразные -- Курообразные -- Журавлеобразные -- Ржанкообразные -- Воробьинообразные -- Вирусы -- дикие птицы -- Поганкообразные -- Веслоногие -- Голенастые -- Фламингообразные -- Соколообразные -- Куриные -- Рябкообразные -- Голубеобразные -- Кукушкообразные -- Козедоеобразные -- Ракшеобразные -- Удодообразные -- Воробьинообразные
Аннотация: В статье обобщаются основные результаты мониторинга циркуляции парамиксовирусов в орнитофауне Казахстана в 2002-2015 гг. Дается характеристика биологических образцов, собранных в 2002- 2015 гг. от птиц различных экологических комплексов на территории РК, за весь период наблюдения выделены 69 изолятов вирусов парамиксовирусов птиц следующих пяти отрядов из 17 изученных: Гусеобразные, Курообразные, Журавлеобразные, Ржанкообразные, Воробьинообразные. Парамиксовирусы изолировались от 20 видов диких птиц относящихся к шести семействам. Казахстанские изоляты принадлежали к следующим серотипам: ПМВ-1, ПМВ-4, ПМВ-6, ПМВ-8, ПМВ-13. Такое разнообразие серотипов свидетельствуют о том, что дикие птицы в Казахстане могут быть потенциальным источником возникновения эпизоотически актуальных вариантов парамиксовирусов птиц
Держатели документа:
ЗКГУ
Доп.точки доступа:
Саятов, М. Х.
Кыдырманов, А. И.
Жуматов, К. Х.
Карамендин, К. О.
Асанова, С. Е.
Даулбаева, К. Д.
Касымбеков, Е. Т.
Хан, Е. Я.
Сулейменова, С. А.
18.
Подробнее
28
А 45
Алгоритм оптимизации ПЦР протокола для выявления микроорганизмов на примере Pasteurella Multocida [Текст] / А. О. Амиргазин [и др.] // Eurasian Journal of Applied Biotechnology. - Астана, 2017. - №3. - С. 33-42
ББК 28
Рубрики: Молекулярная биология
Кл.слова (ненормированные):
Pasteurella multocida -- пцр -- оптимизация -- микроорганизмы -- биотехнология -- молекулярная биология -- эукариоты -- днк -- методы тагучи -- кинетика -- нуклеиновые полимеры -- ветеренария -- генетическая близость бактерий
Аннотация: Полимеразная цепная реакция (ПЦР) является многофункциональным инструментом в молекулярной биологии. Многочисленные модификации ПЦР оптимизированы под конкретные цели и стремятся достичь должной эффективности, специфичности чувствительности. Несмотря на общий «классический» принцип, нет единой схемы оптимизации, учитывающей разнообразие применения ПЦР, по которой исследователь руководствовался бы в случае необходимости. Вместо этого у исследователя имеются данные ранее опубликованных авторов, представивших собственные схемы оптимизации ПЦР. В данной статье мы описываем алгоритм оптимизации ПЦР протокола для выявления микроорганизмов на примере Pasteurella multocida, применяемый нами многократно и позволяющий достичь необходимую специфичность и чувствительность. Наша схема главным образом отличается от других применением индуктивного метода познания специфичности разрабатываемого протокола, использование ПЦР в режиме реального времени с применением SYBRGreenI для мониторинга амплификации в процессе оптимизации, а также простотой и доступностью в разработке и оптимизации диагностической ПЦР, применимой для широкого круга исследователей. В результате были оптимизированы условия ПЦР для двух пар праймеров, тестированных на коллекции образцов ДНК, включающих 92 вида бактерий, 3 вида эукариотических организмов и обладающие чувствительностью к не ниже 5 копиям в геномном эквиваленте Pasteurella multocida.
Держатели документа:
ЗКГУ
Доп.точки доступа:
Амиргазин, А.О.
Шведюк, В.Б.
Куйбагаров, М.А.
Карибаев, Т.Б.
Шевцов, А.Б.
А 45
Алгоритм оптимизации ПЦР протокола для выявления микроорганизмов на примере Pasteurella Multocida [Текст] / А. О. Амиргазин [и др.] // Eurasian Journal of Applied Biotechnology. - Астана, 2017. - №3. - С. 33-42
Рубрики: Молекулярная биология
Кл.слова (ненормированные):
Pasteurella multocida -- пцр -- оптимизация -- микроорганизмы -- биотехнология -- молекулярная биология -- эукариоты -- днк -- методы тагучи -- кинетика -- нуклеиновые полимеры -- ветеренария -- генетическая близость бактерий
Аннотация: Полимеразная цепная реакция (ПЦР) является многофункциональным инструментом в молекулярной биологии. Многочисленные модификации ПЦР оптимизированы под конкретные цели и стремятся достичь должной эффективности, специфичности чувствительности. Несмотря на общий «классический» принцип, нет единой схемы оптимизации, учитывающей разнообразие применения ПЦР, по которой исследователь руководствовался бы в случае необходимости. Вместо этого у исследователя имеются данные ранее опубликованных авторов, представивших собственные схемы оптимизации ПЦР. В данной статье мы описываем алгоритм оптимизации ПЦР протокола для выявления микроорганизмов на примере Pasteurella multocida, применяемый нами многократно и позволяющий достичь необходимую специфичность и чувствительность. Наша схема главным образом отличается от других применением индуктивного метода познания специфичности разрабатываемого протокола, использование ПЦР в режиме реального времени с применением SYBRGreenI для мониторинга амплификации в процессе оптимизации, а также простотой и доступностью в разработке и оптимизации диагностической ПЦР, применимой для широкого круга исследователей. В результате были оптимизированы условия ПЦР для двух пар праймеров, тестированных на коллекции образцов ДНК, включающих 92 вида бактерий, 3 вида эукариотических организмов и обладающие чувствительностью к не ниже 5 копиям в геномном эквиваленте Pasteurella multocida.
Держатели документа:
ЗКГУ
Доп.точки доступа:
Амиргазин, А.О.
Шведюк, В.Б.
Куйбагаров, М.А.
Карибаев, Т.Б.
Шевцов, А.Б.
19.
Подробнее
51.9
O-66
Optimization of multiple-locus variable-number tandem-repeat analysis for bacillus antracis genotyping [Текст] / A. B. Shevtsov [и др.] // Eurasian Journal of Applied Biotechnology. - 2019. - №2. - P. 103-113
ББК 51.9
Рубрики: Эпидемиология
Кл.слова (ненормированные):
Bacillus anthracis -- возбудитель сибирской язвы -- сибирская язва -- заболевание -- генотипирование -- Эпидемиология -- эпидемиологический мониторинг
Аннотация: Bacillus anthracis-возбудитель сибирской язвы, очень опасного заболевания человека и ветеринарии. B. anthracis обладает высокой патогенностью, что приводит к высокой смертности, при этом возможно длительное сохранение живого возбудителя в условиях окружающей среды. Таким образом, генотипирование циркулирующих штаммов B. anthracis является неотъемлемой частью эпидемиологического надзора во всем мире. Анализ множественных локусов с переменным числом тандемных повторов (VNTR) - это высоко дискриминационный метод для генотипирования бактериальных видов с сохраненным геномом, таких как B. anthracis. Хотя уже существует хорошо зарекомендовавшая себя схема типизации MLVA, в некоторых случаях требуется оптимизация протокола и верификация результатов. В данной работе представлены результаты оптимизации протокола MLVA-31, который был верифицирован на четырех штаммах B. anthracis, выделенных в Казахстане. Фактические размеры повторов ВНТР отличались от тех, которые были получены при капиллярном электрофорезе во всех локусах ВНТР. Кроме того, отсутствие референтных штаммов B. anthracis затрудняло идентификацию аллелей в 90% локусов. В шести локусах фактические размеры отличались на один или несколько Внтр от размеров, определяемых методом капиллярного электрофореза. Эти результаты свидетельствуют о том, что наличие референтных штаммов B. anthracis позволит верифицировать результаты генотипирования независимо от конкретных реагентов и оборудования, используемых для капиллярного электрофореза, что позволит повысить эффективность эпидемиологического мониторинга на местном и глобальном уровнях.
Держатели документа:
ЗКГУ
Доп.точки доступа:
Shevtsov, A.B.
Lutsay, V.B.
Kairzhanova, A.D.
Lukhnova, L.Yu.
Kulatay, T.Zh.
Izbanova, U.A.
Karibaev, T.B.
Shustov, A.V.I.
O-66
Optimization of multiple-locus variable-number tandem-repeat analysis for bacillus antracis genotyping [Текст] / A. B. Shevtsov [и др.] // Eurasian Journal of Applied Biotechnology. - 2019. - №2. - P. 103-113
Рубрики: Эпидемиология
Кл.слова (ненормированные):
Bacillus anthracis -- возбудитель сибирской язвы -- сибирская язва -- заболевание -- генотипирование -- Эпидемиология -- эпидемиологический мониторинг
Аннотация: Bacillus anthracis-возбудитель сибирской язвы, очень опасного заболевания человека и ветеринарии. B. anthracis обладает высокой патогенностью, что приводит к высокой смертности, при этом возможно длительное сохранение живого возбудителя в условиях окружающей среды. Таким образом, генотипирование циркулирующих штаммов B. anthracis является неотъемлемой частью эпидемиологического надзора во всем мире. Анализ множественных локусов с переменным числом тандемных повторов (VNTR) - это высоко дискриминационный метод для генотипирования бактериальных видов с сохраненным геномом, таких как B. anthracis. Хотя уже существует хорошо зарекомендовавшая себя схема типизации MLVA, в некоторых случаях требуется оптимизация протокола и верификация результатов. В данной работе представлены результаты оптимизации протокола MLVA-31, который был верифицирован на четырех штаммах B. anthracis, выделенных в Казахстане. Фактические размеры повторов ВНТР отличались от тех, которые были получены при капиллярном электрофорезе во всех локусах ВНТР. Кроме того, отсутствие референтных штаммов B. anthracis затрудняло идентификацию аллелей в 90% локусов. В шести локусах фактические размеры отличались на один или несколько Внтр от размеров, определяемых методом капиллярного электрофореза. Эти результаты свидетельствуют о том, что наличие референтных штаммов B. anthracis позволит верифицировать результаты генотипирования независимо от конкретных реагентов и оборудования, используемых для капиллярного электрофореза, что позволит повысить эффективность эпидемиологического мониторинга на местном и глобальном уровнях.
Держатели документа:
ЗКГУ
Доп.точки доступа:
Shevtsov, A.B.
Lutsay, V.B.
Kairzhanova, A.D.
Lukhnova, L.Yu.
Kulatay, T.Zh.
Izbanova, U.A.
Karibaev, T.B.
Shustov, A.V.I.
20.
Подробнее
Стволинская, Н. С.
Истоки и перспективы международной программы "Геном человека" / Н. С. Стволинская // БИОЛОГИЯ В ШКОЛЕ. - 2002. - #2.-C.12-17.-Библиогр.:С.17(13 источн.)
Рубрики: ОБЩАЯ ГЕНЕТИКА
Кл.слова (ненормированные):
ГЕНЕТИКА -- ГЕН -- МОЛЕКУЛЯРНАЯ ГЕНЕТИКА
Стволинская, Н. С.
Истоки и перспективы международной программы "Геном человека" / Н. С. Стволинская // БИОЛОГИЯ В ШКОЛЕ. - 2002. - #2.-C.12-17.-Библиогр.:С.17(13 источн.)
Рубрики: ОБЩАЯ ГЕНЕТИКА
Кл.слова (ненормированные):
ГЕНЕТИКА -- ГЕН -- МОЛЕКУЛЯРНАЯ ГЕНЕТИКА
Страница 2, Результатов: 35