База данных: Статьи
Страница 1, Результатов: 6
Отмеченные записи: 0
1.
Подробнее
24.1
С 72
Спиридонова, Е. Б.
Урок по теме "Спирты". [Текст] / Е. Б. Спиридонова // Химия в школе. - 2020. - №7. - С. 30-32
ББК 24.1
Рубрики: Общая и бейорганическая химия
Кл.слова (ненормированные):
спирты -- функциональная группа -- гомологи -- изомерия -- физические свойства -- химические свойства
Аннотация: На уроке созданы содержательные ит организационные условия для изучения одноатомных спиртов, формирования навыков грамотного выполнения и интерпретации химического эксперимента, стимулирования обучающихся к целепологанию, планированию деятельности , анализу индивидуальных достижений.
Держатели документа:
ЗКУ
С 72
Спиридонова, Е. Б.
Урок по теме "Спирты". [Текст] / Е. Б. Спиридонова // Химия в школе. - 2020. - №7. - С. 30-32
Рубрики: Общая и бейорганическая химия
Кл.слова (ненормированные):
спирты -- функциональная группа -- гомологи -- изомерия -- физические свойства -- химические свойства
Аннотация: На уроке созданы содержательные ит организационные условия для изучения одноатомных спиртов, формирования навыков грамотного выполнения и интерпретации химического эксперимента, стимулирования обучающихся к целепологанию, планированию деятельности , анализу индивидуальных достижений.
Держатели документа:
ЗКУ
2.
Подробнее
28.070
В 92
Выделение и характеристика кДНК гена поли (Адф-рибоза) полимеразы 2 Arabidopis thaliana [Текст] / А. К. Куанбай [и др.] // Әл - Фараби ат. ҚҰУ Хабаршы = Вестник КазНУ им Аль - Фараби. - Алматы, 2018. - №1(74). - С. 99-110. - (Биология сериясы=Серия биологическая)
ББК 28.070
Рубрики: Молекулярная биология
Кл.слова (ненормированные):
поли (АДФ-рибоза) -- полимераза -- радикалы кислорода -- arabidopsis thaliana -- реакция -- транскрипции -- функциональная экспрессия
Аннотация: Поли(АДФ-рибоза) полимераза (PARP) катализирует синтез полимеров АДФ-рибозы, ковалентно-прикрепленные к акцепторным белкам, при этом донором остатков АДФ-рибозы выступает НАД+. Геном Arabidopsis thaliana, широко используемого модельного растительного организма, кодирует по меньшей мере три предполагаемых PARP фермента: АtPARP1 (At4g02390), AtPARP2 (At2g31320) и AtPARP3 (At5g22470). PARP растений являются структурно гомологичными к PARP белкам млекопитающих. Высокая степень консервативности на уровне аминокислотной последовательности между ферментами арабидопсиса и млекопитающих позволяет предположить, что в растениях PARP выполняет аналогичные функции как в животных системах. Однако в отличие от млекопитающих, значительно мало известно о поли-АДФ-рибозилирований в растениях.
Держатели документа:
ЗКГУ
Доп.точки доступа:
Куанбай, А.К.
Смекенов, И.Т.
Сапарбаев, М.К.
Ищенко, А.А.
Тайпакова, С.М.
Бисенбаев, А.К.
В 92
Выделение и характеристика кДНК гена поли (Адф-рибоза) полимеразы 2 Arabidopis thaliana [Текст] / А. К. Куанбай [и др.] // Әл - Фараби ат. ҚҰУ Хабаршы = Вестник КазНУ им Аль - Фараби. - Алматы, 2018. - №1(74). - С. 99-110. - (Биология сериясы=Серия биологическая)
Рубрики: Молекулярная биология
Кл.слова (ненормированные):
поли (АДФ-рибоза) -- полимераза -- радикалы кислорода -- arabidopsis thaliana -- реакция -- транскрипции -- функциональная экспрессия
Аннотация: Поли(АДФ-рибоза) полимераза (PARP) катализирует синтез полимеров АДФ-рибозы, ковалентно-прикрепленные к акцепторным белкам, при этом донором остатков АДФ-рибозы выступает НАД+. Геном Arabidopsis thaliana, широко используемого модельного растительного организма, кодирует по меньшей мере три предполагаемых PARP фермента: АtPARP1 (At4g02390), AtPARP2 (At2g31320) и AtPARP3 (At5g22470). PARP растений являются структурно гомологичными к PARP белкам млекопитающих. Высокая степень консервативности на уровне аминокислотной последовательности между ферментами арабидопсиса и млекопитающих позволяет предположить, что в растениях PARP выполняет аналогичные функции как в животных системах. Однако в отличие от млекопитающих, значительно мало известно о поли-АДФ-рибозилирований в растениях.
Держатели документа:
ЗКГУ
Доп.точки доступа:
Куанбай, А.К.
Смекенов, И.Т.
Сапарбаев, М.К.
Ищенко, А.А.
Тайпакова, С.М.
Бисенбаев, А.К.
3.
Подробнее
28.070
С 56
Совместное влияние аминокислотной последовательности ДНК на структуру хроматосомы: анализ методами молекулярного моделирования [Текст] / Т. К. Горковец [и др.] // Вестник Московского университета . - Москва, 2018. - №2. - С. 99-105
ББК 28.070
Рубрики: Молекулярная биология
Кл.слова (ненормированные):
хроматосома -- нуклеосома -- хроматин -- линкерный гистон -- линкерная ДНК -- гибкость ДНК -- моделирование по гомологии
Аннотация: Хроматосома, состоящая из нуклеосомного ядра, линкерных участков ДНК и линкерного гистона (ЛГ), является важным структурным элементом хроматина
Держатели документа:
ЗКГУ
Доп.точки доступа:
Горковец, Т.К.
Армеев, Г.А.
Шайтан, К.В.
Шайтан, А.К.
С 56
Совместное влияние аминокислотной последовательности ДНК на структуру хроматосомы: анализ методами молекулярного моделирования [Текст] / Т. К. Горковец [и др.] // Вестник Московского университета . - Москва, 2018. - №2. - С. 99-105
Рубрики: Молекулярная биология
Кл.слова (ненормированные):
хроматосома -- нуклеосома -- хроматин -- линкерный гистон -- линкерная ДНК -- гибкость ДНК -- моделирование по гомологии
Аннотация: Хроматосома, состоящая из нуклеосомного ядра, линкерных участков ДНК и линкерного гистона (ЛГ), является важным структурным элементом хроматина
Держатели документа:
ЗКГУ
Доп.точки доступа:
Горковец, Т.К.
Армеев, Г.А.
Шайтан, К.В.
Шайтан, А.К.
4.
Подробнее
24.5
Э 45
Электронные параметры 1,1,1-трифторалканов [Текст] / А. В. Котомкин [и др.] // Известия высших учебных заведений. Серия: Химия и химическая технология. - 2019. - Т.62(1). - С. 31-37
ББК 24.5
Рубрики: Физическая химия. Химическая физика
Кл.слова (ненормированные):
индуктивный эффект -- электроотрицательность -- квантовая теория атомов в молекуле -- электронная плотность -- трифторалканы -- электронные параметры -- химия
Аннотация: На основании квантово-химических расчетов рассмотрены свойства групп гомологического ряда молекул третичных фторзамещенных углеводородов CnH2n+1-CF3 (n ≤ 9), полученные из распределения их электронной плотности. Проведена оптимизация геометрии десяти исследуемых структур, определены поверхности нулевого потока градиента электронной плотности и найдены бассейны атомных групп и атомов фтора. Для молекул трифторалканов получены и проанализированы групповые электронные интегральные характеристики: заряд q(R), энергия E(R) и объем V(R). Выявлена связь между длиной углеводородной цепи и переносимостью свойств выбранных групп СF3, СН3, СН2, что нашло отражение в их переносимых параметрах. Построена качественная шкала групповых электроотрицательностей изучаемого ряда и рассмотрен индуктивный эффект (I-эффект) фторсодержащего концевого фрагмента. Выявлено затухание I-эффекта в CnH2n+1-CF3 (n ≥ 6) на молекулярных фрагментах CF3-(CH2)4 и CH3-CH2, в связи с чем, начиная с n > 6, отмечено появление «стандартной» группы CH2. Описан выбор «стандартного» («переносимого») значения полной электронной энергии групп E(R) и вычисление относительной групповой энергии ΔE(R). Показано вызванное перетеканием электронной плотности уменьшение объемов двух групп СН2, расположенных рядом с СF3. Проведен сравнительный анализ зарядов всех выделенных в CnH2n+1-CF3 (n ≤ 9) групп с соответствующими q(R) в монофторзамещенных алканах, монофторалкильных радикалах, дифторзамещенных алканах, дифторалкильных радикалах. Данные по сравнению зарядовых характеристик идентичных групп и фторсодержащего фрагмента нонильных замещенных фтора и их радикалов изображены в виде графической зависимости, рассмотрение которой дает представление о затухании индуктивного эффекта от СF3.
Держатели документа:
ЗКГУ
Доп.точки доступа:
Котомкин, А.В.
Русакова, Н.П.
Туровцев, В.В.
Орлов, Ю.Д.
Э 45
Электронные параметры 1,1,1-трифторалканов [Текст] / А. В. Котомкин [и др.] // Известия высших учебных заведений. Серия: Химия и химическая технология. - 2019. - Т.62(1). - С. 31-37
Рубрики: Физическая химия. Химическая физика
Кл.слова (ненормированные):
индуктивный эффект -- электроотрицательность -- квантовая теория атомов в молекуле -- электронная плотность -- трифторалканы -- электронные параметры -- химия
Аннотация: На основании квантово-химических расчетов рассмотрены свойства групп гомологического ряда молекул третичных фторзамещенных углеводородов CnH2n+1-CF3 (n ≤ 9), полученные из распределения их электронной плотности. Проведена оптимизация геометрии десяти исследуемых структур, определены поверхности нулевого потока градиента электронной плотности и найдены бассейны атомных групп и атомов фтора. Для молекул трифторалканов получены и проанализированы групповые электронные интегральные характеристики: заряд q(R), энергия E(R) и объем V(R). Выявлена связь между длиной углеводородной цепи и переносимостью свойств выбранных групп СF3, СН3, СН2, что нашло отражение в их переносимых параметрах. Построена качественная шкала групповых электроотрицательностей изучаемого ряда и рассмотрен индуктивный эффект (I-эффект) фторсодержащего концевого фрагмента. Выявлено затухание I-эффекта в CnH2n+1-CF3 (n ≥ 6) на молекулярных фрагментах CF3-(CH2)4 и CH3-CH2, в связи с чем, начиная с n > 6, отмечено появление «стандартной» группы CH2. Описан выбор «стандартного» («переносимого») значения полной электронной энергии групп E(R) и вычисление относительной групповой энергии ΔE(R). Показано вызванное перетеканием электронной плотности уменьшение объемов двух групп СН2, расположенных рядом с СF3. Проведен сравнительный анализ зарядов всех выделенных в CnH2n+1-CF3 (n ≤ 9) групп с соответствующими q(R) в монофторзамещенных алканах, монофторалкильных радикалах, дифторзамещенных алканах, дифторалкильных радикалах. Данные по сравнению зарядовых характеристик идентичных групп и фторсодержащего фрагмента нонильных замещенных фтора и их радикалов изображены в виде графической зависимости, рассмотрение которой дает представление о затухании индуктивного эффекта от СF3.
Держатели документа:
ЗКГУ
Доп.точки доступа:
Котомкин, А.В.
Русакова, Н.П.
Туровцев, В.В.
Орлов, Ю.Д.
5.
Подробнее
24.5
Н 76
Новоселецкий, В. Н.
Составление и анализ матриц аминокислотных замен для оптимального выравнивания последовательностей микробных родопсинов [Текст] / В. Н. Новоселецкий, Г. А. Армеев, К. В. Шайтан // Вестник Московского университета . - Москва, 2019. - №1. - С. 27-33. - (Серия биология)
ББК 24.5
Рубрики: Физическая химия
Кл.слова (ненормированные):
микробные родопсины -- гелиородопсин -- матрица замен -- энтропия -- выравнивание последовательностей -- поиск гомологов -- аминокислотные замены -- биоинформатика -- фотохимически активные белки -- прокариот -- эукариот -- электрохимический потенциал
Аннотация: Парное выравнивание аминокислотных последовательностей является основным инструментом биоинформатики, используемым как самостоятельно, так и в большом числе более сложных методов. Эффективность этого инструмента критически зависит от используемой оценочной функции, которая состоит из матрицы замен и штрафов за вставку. В настоящей работе выполнены построение и анализ матриц аминокислотных замен для надсемейства микробных родопсинов (RHOD), а также проведено их сопоставление с рядом матриц замен общего назначения (BLOSUM, VTML, PFASUM). Показано, что все матрицы позволяют строить выравнивания последовательностей микробных родопсинов практически одинакового качества, но лишь матрицы семейств BLOSUM и VTML, а также их линейные комбинации с матрицами семейства RHOD позволяют обнаруживать гомологию между микробными родопсинами и гелиородопсином.
Держатели документа:
ЗКГУ
Доп.точки доступа:
Армеев, Г.А.
Шайтан, К.В.
Н 76
Новоселецкий, В. Н.
Составление и анализ матриц аминокислотных замен для оптимального выравнивания последовательностей микробных родопсинов [Текст] / В. Н. Новоселецкий, Г. А. Армеев, К. В. Шайтан // Вестник Московского университета . - Москва, 2019. - №1. - С. 27-33. - (Серия биология)
Рубрики: Физическая химия
Кл.слова (ненормированные):
микробные родопсины -- гелиородопсин -- матрица замен -- энтропия -- выравнивание последовательностей -- поиск гомологов -- аминокислотные замены -- биоинформатика -- фотохимически активные белки -- прокариот -- эукариот -- электрохимический потенциал
Аннотация: Парное выравнивание аминокислотных последовательностей является основным инструментом биоинформатики, используемым как самостоятельно, так и в большом числе более сложных методов. Эффективность этого инструмента критически зависит от используемой оценочной функции, которая состоит из матрицы замен и штрафов за вставку. В настоящей работе выполнены построение и анализ матриц аминокислотных замен для надсемейства микробных родопсинов (RHOD), а также проведено их сопоставление с рядом матриц замен общего назначения (BLOSUM, VTML, PFASUM). Показано, что все матрицы позволяют строить выравнивания последовательностей микробных родопсинов практически одинакового качества, но лишь матрицы семейств BLOSUM и VTML, а также их линейные комбинации с матрицами семейства RHOD позволяют обнаруживать гомологию между микробными родопсинами и гелиородопсином.
Держатели документа:
ЗКГУ
Доп.точки доступа:
Армеев, Г.А.
Шайтан, К.В.
6.
Подробнее
24.5
Р 88
Русакова, Н. П.
Электронное строение радикалов эфиров сульфоксиловой кислоты [Текст] / Н. П. Русакова // Химия и химическая технология. - 2019. - Т.62. - №10. - С. 96-102
ББК 24.5
Рубрики: Физическая химия
Кл.слова (ненормированные):
электронная плотность -- радикальный центр -- электроотрицательность -- индуктивный эффект -- спиновая плотность
Аннотация: Методом функционала плотности B3LYP/6-311++G(3df,3pd) проведена оптимизация геометрии радикалов эфиров сульфоксиловой кислоты. Получены распределения электронной плотности для первых девяти соединений гомологического ряда н-CH3-(CH2)n-(O-S-O)●, где n ≤ 8. Водородная связь, существующая в исходных молекулах неразветвленных эфиров сульфоксиловой кислоты между водородом второго углеродного атома алкильной цепи (от эфирной связи) и кислородом гидроксильной группы серосодержащего фрагмента (-C(Н)H-CH2-O-S-ОН), и соответствующий цикл в радикалах не наблюдаются. Предложена фрагментация структур на топологические группы CH3, CH2, и (-O-S-O)● и представлены их электронные интегральные характеристики: заряд, доля неспаренного электрона, энергия и объём. На основании закономерностей в зарядах групп гомологов установлена дальность и интенсивность индуктивного влияния фрагмента (-O-S-O)● и рассмотрено стерическое воздействие на углеводородную цепь. Шкала групповых электроотрицательностей изученных гомологов построена посредством сопоставления зарядов топологических групп. Анализ распределения спиновой плотности позволил отнести положение радикального центра фрагменту (-O-S-O)● (с долей неспаренного электрона в бассейне атома серы 0,57, в бассейне атома кислорода 0,32 и в бассейне кислорода по эфирной связи 0,10). Установлена величина вклада группы CH2 в полную энергию гомологов исследуемого ряда, которая составила 103260 кДж/моль. Получено «стандартное» значение полной электронной энергии и рассмотрены относительные энергии (ΔE(R)) групп в углеводородной цепи. Показано дестабилизирующее влияние более электроотрицательных фрагментов. Отмечено уменьшение объёмов двух групп CH2, ближайших к (-O-S-O)●, вызванное оттоком электронной плотности на (-O-S-O)●.
Держатели документа:
ЗКГУ
Доп.точки доступа:
Туровцев , В.В.
Орлов, Ю.Д.
Котомкин, А.В.
Р 88
Русакова, Н. П.
Электронное строение радикалов эфиров сульфоксиловой кислоты [Текст] / Н. П. Русакова // Химия и химическая технология. - 2019. - Т.62. - №10. - С. 96-102
Рубрики: Физическая химия
Кл.слова (ненормированные):
электронная плотность -- радикальный центр -- электроотрицательность -- индуктивный эффект -- спиновая плотность
Аннотация: Методом функционала плотности B3LYP/6-311++G(3df,3pd) проведена оптимизация геометрии радикалов эфиров сульфоксиловой кислоты. Получены распределения электронной плотности для первых девяти соединений гомологического ряда н-CH3-(CH2)n-(O-S-O)●, где n ≤ 8. Водородная связь, существующая в исходных молекулах неразветвленных эфиров сульфоксиловой кислоты между водородом второго углеродного атома алкильной цепи (от эфирной связи) и кислородом гидроксильной группы серосодержащего фрагмента (-C(Н)H-CH2-O-S-ОН), и соответствующий цикл в радикалах не наблюдаются. Предложена фрагментация структур на топологические группы CH3, CH2, и (-O-S-O)● и представлены их электронные интегральные характеристики: заряд, доля неспаренного электрона, энергия и объём. На основании закономерностей в зарядах групп гомологов установлена дальность и интенсивность индуктивного влияния фрагмента (-O-S-O)● и рассмотрено стерическое воздействие на углеводородную цепь. Шкала групповых электроотрицательностей изученных гомологов построена посредством сопоставления зарядов топологических групп. Анализ распределения спиновой плотности позволил отнести положение радикального центра фрагменту (-O-S-O)● (с долей неспаренного электрона в бассейне атома серы 0,57, в бассейне атома кислорода 0,32 и в бассейне кислорода по эфирной связи 0,10). Установлена величина вклада группы CH2 в полную энергию гомологов исследуемого ряда, которая составила 103260 кДж/моль. Получено «стандартное» значение полной электронной энергии и рассмотрены относительные энергии (ΔE(R)) групп в углеводородной цепи. Показано дестабилизирующее влияние более электроотрицательных фрагментов. Отмечено уменьшение объёмов двух групп CH2, ближайших к (-O-S-O)●, вызванное оттоком электронной плотности на (-O-S-O)●.
Держатели документа:
ЗКГУ
Доп.точки доступа:
Туровцев , В.В.
Орлов, Ю.Д.
Котомкин, А.В.
Страница 1, Результатов: 6