Электронный каталог

24.5
C73

    Conformational behavior of hydrazone derived from pyridoxal 5’-phosphate and isoniazid [Текст] / A. Е. Pogonin [et al.] // Известия высших учебных заведений. - Иваново, 2018. - №12. - Р. 101-107. - (Серия химия и химическая технология)
ББК 24.5

Рубрики: Физическая химия. Химическая физика

Кл.слова (ненормированные):
пиридоксаль-5-фосфат -- изониазид -- гидразон -- конформер -- активационный барьер -- молекулы -- стабильный конформер -- депротонированный гидразон -- квантовая химия -- Количественный QTAIM анализ -- ионы металла -- гидразон PLP-INH3 -- молекулярный докинг -- G-белок
Аннотация: Гидразоны, производные пиридоксаля либо пиридоксаль-5-фосфата или гетероциклических гидразидов, представляют интерес, благодаря своей потенциальной биологической активности и возможности использования в качестве сенсоров на ионы металлов. Эти свойства гидразонов могут зависеть от конформационных равновесий молекулы, поскольку наиболее стабильный конформер может отличаться от формы с наибольшим сродством к биомолекуле либо иону металла. В настоящей работе депротонированный гидразон, производный пиридоксаль-5-фосфата и изониазида (PLP-INH3-), исследован методами квантовой химии. Для этого гидразона возможны 3 различных вращения, приводящих к 8 конформерам, однако 4 из них, полученные при вращении пиридинового кольца остатка изониазида, являются вырожденными. С использованием теории функционала плотности (B3LYP/6-311++G(d,p)) были оптимизированы геометрические характеристики различных невырожденных конформеров вращения данного гидразона (различающихся взаимной ориентацией карбонильной группы остатка изониазида и атома кислорода в положении 3 остатка PLP), а также оценены активационные барьеры переходов между ними. Обсуждаются изменения в энергии и строении конформеров, а также переходных состояний. Количественный QTAIM (Quantum Theory of Atoms in Molecules) анализ был проведен с целью проверки наличия внутримолекулярных водородных связей. Формы гидразона, способные образовывать комплекс с ионами металлов, отличаются от наиболее устойчивых (по величинам полной энергии) конформеров. Была проведена предварительная оценка биологической активности гидразона PLP-INH3-, а также молекулярный докинг для гидразона и киназы G-белок сопряженного рецептора. Определена предпочтительная конформация для связывания лиганда с активным сайтом киназы.
Держатели документа:
ЗКГУ
Доп.точки доступа:
Pogonin, A.Е.
Gamov , G.A.
Zavalishin , M.N.
Sharnin , V.A.

22.3
F97

    Functions of atoms radial distribution and pair potential of some semiconductors melts [Текст] / А. Z. Issagulov [et al.] // Вестник национальной академии наук Республики Казахстан=The bulletin the national academy of sciences of the Republic Of Kazakhstan. - Almaty, 2019. - №4. - Р. 6-14
ББК 22.3

Рубрики: Физика

Кл.слова (ненормированные):
парные потенциалы -- радиальные распределения атомов -- полупроводник -- функционал плотности -- структурный фактор -- атомы -- молекулярная динамика -- кластерная структура -- электростатическая теорема Гельмана–Фейнмана -- электронная плотность -- межъядерный потенциал
Аннотация: В работе приведена оценка парного потенциала и построение кривых радиального распределения атомов в некоторых расплавах полупроводников, таких как германий, кремний с использованием проведенных исследований в рамках функционала плотности. Приведены результаты расчетов потенциала парного взаимодействия в расплаве германия с привлечением экспериментальных данных В. М. Глазова и квантовые потенциалы парного взаимодействия, полученные квантовохимическими методами, соответственно. Теоретически исследованы температурные зависимости радиальной функции распределения атомов в расплавах селена, теллура, кремния и германия. Рассмотрены результаты расчета кривых радиального распределения атомов, рассчитанные методом молекулярной динамики. Если предположить, что положение первого максимума кривой радиального распределения атомов в расплаве соответствует кратчайшему межатомному расстоянию в атомных цепях, то следует сделать заключение, что при плавлении кристалла это расстояние увеличивается и получается искаженная кристаллическая структура. Потенциал парного взаимодействия в расплавах германия, кремния с использованием проведенных исследований оценивается в рамках функционала плотности. Парные потенциалы вычисляются по электростатической теореме Гельмана–Фейнмана, после нахождения оптимальной электронной плотности, соответствующей равновесный межъядерный интервал
Держатели документа:
ЗКГУ
Доп.точки доступа:
Issagulov, А. Z.
Belomestny, D.
Shaiкhova, G. S.
Zhurov, V. V.
Kasymova, L. Zh.
Zhetimekova, G. Zh.